北京儿童医院眼科成立至今已有40余年的历史，在医院领导的大力支持下，不断发展壮大，由最初的单一门诊发展成为目前拥有门诊(包括专家、专业和普通门诊)、病房、验光配镜中心、弱视训练为一体的综合性小儿眼科。
现有医护技人员共66人，其中医生25名，视光技师及弱视训练师5名，护士36名。包括正主任医师4名，副主任医师10名，主治医师6名。博士9名，硕士14名。
历经多年努力和人才梯队建设，队伍不断壮大、专业日趋完善，临床技术精湛、仪器设备先进、具有较高的学术水平。每年接诊来自全国各地的各种眼病患儿近12万人次，日均门诊量400余人次，高峰日均500-700人次左右，暑期门诊量最高可达1100人次。
目前眼科设有泪道专业、斜弱视专业、验光配镜专业、白内障、青光眼，眼底疾病治疗。在小儿斜视、泪道疾病、眼整形、近视弱视治疗、特种眼镜验配、视网膜母细胞瘤治疗等方面居国内领先水平，有的接近或达到国际水平。除常规斜视、弱视、泪道检查外，还开展了角膜内皮镜检查、视野检查、VEP及ERG检查等。
病房设有病床34张，年均手术量3500余例。眼科经过多年临床实践，斜视矫正手术自创改良眼外肌后徙调整缝线技术，使手术的一次成功率高达90％以上，取得良好治疗效果。眼科还开展了其他的特色治疗项目：Ritleng泪道插管手术、泪道球囊管扩张手术、利用GORE-TEX新型材料额肌悬吊术治疗儿童上睑下垂、儿童视网膜母细胞瘤综合治疗、超声乳化白内障手术、青光眼手术、眼底激光手术、视网膜玻璃体切割手术等，首创的全新微创泪道再建手术达到了国际先进水平，治愈各种儿童复杂性泪道疾患近30000例，正式成立了北京儿童医院眼科眼球震颤治疗小组，对本病进行了较为深入全面的研究和临床实践，并在此基础上开展了特发性眼球震颤的手术治疗方法，提高了患儿的视功能，手术后大部分患儿眼球震颤都能够得到减轻。
在科、教、研方面，眼科承担首都医科大学7年制儿科系的教学任务，承担每年来自全国各地基层小儿眼科进修医师的培训工作，已经在专业期刊上发表论文数十篇，在SCI上发表论文数篇。