云南治疗综合疾病比较好的医院有1、云南省第三人民医院，2、云南省第二人民医院，3、昆明医科大学第二附属医院，4、昆明市第一人民医院，5、昆明市延安医院；云南省第三人民医院综合疾病医疗设施齐全，在综合疾病治疗方面有着丰富的经验；云南省第二人民医院综合疾病医疗储备人员丰富，对综合疾病有着独到的见解和优势。