北医三院泌尿外科成立于1958年,建院之初就已成为我院的独立学科。经过几代人近半个世纪的不懈努力,我科已发展成为集临床、科研、教学于一体,国际知名、国内领先的泌尿外科中心。目前,我科年手术量已超过近2000台,年门诊量已近10万人次,年住院量也已达2000余人次。北医三院泌尿外科是我院外科系统的主要组成部分之一,也是高等学校国家级重点学科,院级八个重点学科之一。现任科主任为知名泌尿外科专家马潞林教授。
　　北医三院泌尿外科现有两个病区,床位64张,教授、主任医师8人（包括博士生导师1人）,副教授、副主任医师8人,主治医师5人。下属普通泌尿外科学、微创泌尿外科学、器官移植学、男性生殖医学、泌尿生殖系肿瘤、泌尿系结石、尿控等多个专业组,学科覆盖面广,综合实力雄厚。
　　北医三院泌尿外科多年来,泌尿外科不断开拓进取,学习应用和推广新技术、新疗法。微创手术是未来泌尿外科发展的方向,1998年以来,腹腔镜手术已经逐步取代了我科的大部分开放手术。目前我科主要腹腔镜手术包括：活体供肾切取术（已完成156例,居全国首位）、前列腺癌根治术（超过200例）、膀胱全切Studer膀胱术或Bricker膀胱术（超过100例）、肾癌根治术、肾部分切除术、肾输尿管全长切除术、肾盂输尿管成形术、输尿管切开取石术、肾上腺肿瘤切除术、腹膜后肿瘤切除术、腹膜后淋巴结清扫术等。目前,国家卫生部批准我院泌尿外科为内镜诊疗技术培训基地,为北京市最早被批准的两家基地之一。

　　北医三院泌尿外科85％的住院手术病人都通过微创手术得到治疗。例如,98％的前列腺增生接受经尿道手术（TURP）、99％的泌尿系统结石通过体外冲击波碎石或内腔镜治疗（包括腹腔镜、经皮肾镜、输尿管镜手术）,对于肾上腺肿瘤、肾肿瘤、肾盂及输尿管肿瘤、前列腺癌、膀胱癌,常规行腹腔镜手术。2004～2009年,我科成功举办了六届（国家级）微创泌尿外科学习班,另外成功举办了两届腹腔镜亲属供肾移植学习班和两届钬激光经皮肾镜学习班,总计培训学员1800人以上。
　　北医三院泌尿外科器官移植水平一直处于国内领先地位。截止2009年12月,我科已累计完成肾移植1200余例,肾移植病人术后一年存活率为98.3％,达到国际先进水平。亲属肾移植目前累计完成183例,其中开放取收起↑