普通外科是北京世纪坛医院重点科室之一。下设腹腔镜中心、腹壁与疝外科治疗中心、肥胖病治疗中心、肝胆外科中心。以各专业化的中心为特色，强调深入研究，扩大交流，保持与国内国际先进水平看齐。
　　普通外科能够完成特大、高难度手术，如巨大而复杂的肝癌，肝巨大血管瘤，晚期肿瘤，门脉高压上消化道大出血，胆管癌特别是肝门部高位胆管癌，巨大胸骨后甲状腺肿等的高难手术。能抢救各类休克、大外伤多脏器功能受损、重症胆管炎、重症胰腺炎等特别危重患者。特别是各中心的临床和研究工作均处国内先进水平。在胃肠功能研究方面，根据病情，进行个性化选择、实施肠内、肠外营养，对肠梗阻、肠瘘、过度肥胖病人、重症胰腺炎、大创伤的治疗迅速而有效。
　　普通外科现有正主任医师2名，副主任医师6名，博士2名，硕士6名，硕士生导师3名，护士31人，主管护师4人。现有床位55张，有腹腔镜三台、胆道镜、胰十二指肠镜、超声刀、氩气刀等先进设备。