江苏南京治疗综合疾病比较好的三级医院有1、南京明基医院，2、南京同仁医院；南京明基医院综合疾病医疗设施齐全，在综合疾病治疗方面有着丰富的经验；南京同仁医院综合疾病医疗储备人员丰富，对综合疾病有着独到的见解和优势。