北京治疗性病疾病比较好的医院有1、北京大学第一医院，2、陆军总医院，3、首都医科大学宣武医院，4、首都医科大学附属北京同仁医院，5、首都医科大学附属北京安贞医院；北京大学第一医院性病疾病医疗设施齐全，在性病疾病治疗方面有着丰富的经验；陆军总医院性病疾病医疗储备人员丰富，对性病疾病有着独到的见解和优势。