全国治疗儿童孤独症比较好的三甲医院有1、北京中医药大学附属护国寺中医医院，2、北京大学第六医院，3、天津市中西医结合医院，4、清远市人民医院，5、北京安定医院等，儿童孤独症属于儿科，北京中医药大学附属护国寺中医医院儿科疾病医疗设施齐全，在儿科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京大学第六医院儿科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京中医药大学附属护国寺中医医院儿科
护国寺中医医院是北京市最早的公立中医医疗机构。早在六十年代，就作为北京中医学院(现北京中医药大学)的教学、实习医院，医院开设有内、外、针灸、肿瘤、骨科8个病区;门诊设有内、外、针、骨、妇、儿、皮、眼、五官、口腔、急诊及放射、CT、检验、心电、超声、心脑功能捡查、手术室、中西药房、中西药制剂等科室20余个;有普通门诊、专家门诊为患者提供优质服务，全国著名中医内科专家许彭龄教授等众多专家定期应诊。
第二名北京大学第六医院儿科
北京大学精神卫生研究所(北京大学第六医院、北京大学精神卫生学院)是北京大学精神病学与精神卫生学的临床医疗、人才培训与科学研究基地，是世界卫生组织(WHO)北京精神卫生研究和培训协作中心，也是中国疾病预防控制中心的精神卫生中心。北京大学的精神病学专业创建于1942年，为北京大学医学院附属医院设立的神经精神科。
第三名天津市中西医结合医院儿科
天津市中西医结合医院暨南开医院始建于1947年，是一所以中西医结合为主要特色，以中西医结合临床外科为龙头学科，集医疗、科研、教学、预防为一体的三级甲等综合性医院，分别被确定为“全国百姓放心示范医院”和全国重点中西医结合医院。天津市中西医结合研究院挂靠在我院，并设有中西医结合外科博士后流动站及天津市中西医结合急腹症研究所。医院现固定资产总值近9亿元，开设临床、医技科室40余个，开放床位856张，建筑面积近12万平方米，拥有现代化的功能设计和管理流程以及协调优美的就医环境。著名中西医结合普外科专家吴咸中院士任名誉院长，王西墨任院长。
第四名清远市人民医院儿科
清远市人民医院始建于1939年，1995年被评为首批三级甲等医院，占地16.5万平方米，总建筑面积22.3万平方米，包括门诊楼、住院楼、医技楼、行政楼、后勤楼，院区采用园林式绿化，拥有达6万平方米的绿化面积，树木林立、鲜花绽放、草坪葱郁，营造出洁净幽雅的舒适环境；以医院长廊为轴线，实现医疗业务用房一体化，管理集中，诊疗分流，服务措施处处体现以人为本的理念，成为融功能化、人文化、智能化、园林化的初具现代化的大型医院。
第五名北京安定医院儿科
首都医科大学附属北京安定医院创建于1914年，是全国最早的公立精神专科医院。医院是北京市医管局直属的三级甲等专科医院，承担着医疗、教学、科研、预防、社会服务和对外交流等项任务。医院现有职工952人，其中专业技术人员745人。医院总占地面积25960平方米，总建筑面积29557平方米，现有编制床位800张。 [收起]