辽宁治疗肠功能紊乱比较好的三甲医院有1、辽宁省金秋医院，2、朝阳市中心医院，3、抚顺市中心医院，4、阜新市中心医院，5、丹东市第一医院等，肠功能紊乱属于中医科，辽宁省金秋医院中医科疾病医疗设施齐全，在中医科疾病治疗方面有着丰富的经验；朝阳市中心医院中医科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名辽宁省金秋医院中医科
辽宁省金秋医院已成为全省最大的老年病防治中心、辽宁省省直单位职工基本医疗保险指定医院、省工伤指定医疗单位、沈阳市职工基本医疗保险指定医院,国际紧急求援中心（SOS）网络医院、新加坡安盛援助私人有限公司指定合作医院、上海威尔比医疗咨询有限公司指定合作医院、日本32家医疗保险公司指定合作医院、北京蒙迪艾尔援助有限公司合作医院。
第二名朝阳市中心医院中医科
医院是朝阳市唯一一所三级甲等医院，医院设行政科室25个，临床科室43个，医技科室21个。循环内科、普外科等19个临床医技科室被评为市一级重点专科。医疗技术是医院发展的关键，也是医疗水平的重要标志。虽然医院的实验设备相对落后，实验环境相对简陋，但是医院每年都能顺利开展近50项新技术、新项目。
第三名抚顺市中心医院中医科
抚顺市中心医院始建于1969年，是抚顺地区集医疗、科研、教学、预防保健为一体的全国首批三级甲等综合性医院。是大连医科大学、中国医科大学、辽宁中医药大学教学医院、北京协和医院技术协作医院。是卫生部脑卒中筛查基地、辽宁省产前诊断中心抚顺分中心、市急救中心、市临床检验质控中心、市医学影像质控中心、市护理质控中心。是省全科医师培训基地、省住院医师规范化培训基地。医院占地面积4.6万平方米，建筑面积近7万平方米。编制床位1200张，实际开放床位853张。拥有高级职称209人，市青年学科带头人14人，在市级以上学术团体任职162人（次）。
第四名阜新市中心医院中医科
阜新市中心医院是辽西地区集医疗、预防、科研、教学、康复为一体的大型综合性三级甲等医院，是中国医科大学附属一院联盟医院、中国医科大学、辽宁医学院、沈阳医学院的教学医院和辽宁医学院临床学院。中心医院名医荟萃，医疗实力雄厚，优秀的专家团队享誉一方。医院拥有普通外科、神经外科、消化内科、血液净化中心、食管癌治疗中心、检验中心、循环内科七个市级重点专科和以呼吸内科、神经内科、肿瘤科、骨科、眼科、耳鼻喉科为代表的医院优势学科，全力打造脑病诊治中心、心血管诊治中心、肿瘤诊治中心、康复治疗中心。
第五名丹东市第一医院中医科
丹东市第一医院成立于1928年，经80年的发展已成为一家集预防、医疗和教学科研为一体的综合性三级甲等医院，辽宁省政府指定刑事医学鉴定医院。2005年9月，在丹东市政府与清华大学产业集团的共同推动下，丹东市第一医院加入清华高科技国有上市公司诚志股份的医疗健康产业行列，迎来了新一轮的快速发展。医院总资产3.21个亿，占地面积74600平方米，开放床位1015张。为适应丹东市民就医需求，3.2万多平方米新建医疗大楼现已投入使用，改善了就医环境。 [收起]