北京治疗甲状腺囊肿比较好的三级医院有1、航天中心医院，2、北京小汤山医院，3、北京工人疗养院等，甲状腺囊肿属于，航天中心医院疾病医疗设施齐全，在疾病治疗方面有着丰富的经验；北京小汤山医院口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名航天中心医院
航天中心医院是集医疗、教学、科研于一体的大型三级综合性医院，是北京大学的临床医学院、北京急救中心西区分中心、航天体检中心、国家临床药理试验机构、北京市职业健康检查机构、北京市工伤定点医疗机构，是全国百姓放心百佳示范医院。
第二名北京小汤山医院
北京小汤山医院又名北京小汤山疗养院、北京小汤山康复医院、北京国际药膳博物馆。设有各种室内水疗、体疗、理疗、康复、健身等系列医疗康复保健项目，可提供健康管理、健康体检、门诊就医、住院治疗、健康疗养、综合康复、科学健身、会议接待等多种服务。其中门诊部设有内科、外科、妇产科、耳鼻喉科、眼科、口腔科、皮肤科、康复医学科、中医科等临床科室及机能科、检验科、放射科药剂科等辅助科室，住院部分为综合内科、外科及康复中心。
第三名北京工人疗养院
北京康复中心是一所集医疗、康复、科研、疗休养于一体的现代化综合性医院，是北京市总工会下属的全民所有制事业单位。编制床位848张，目前开放医疗床位500张，疗休养床位97张。共占地132亩。中心1995年被国家批准为涉外医疗机构；1999年成为北京市劳动模范健康体检唯一定点医疗单位；2000年被指定为北京市医疗保险定点医院（医保号：07110006）；2001年被批准为北京市工伤定点医院；2008年... [收起]