黑龙江治疗脑炎比较好的三甲医院有1、哈尔滨市中医院，2、黑龙江省医院南岗分院，3、佳木斯市中心医院，4、佳木斯大学第五临床医院，5、齐齐哈尔医学院第一附属医院等，脑炎属于神经内科，哈尔滨市中医院神经内科疾病医疗设施齐全，在神经内科疾病治疗方面有着丰富的经验；黑龙江省医院南岗分院神经内科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名哈尔滨市中医院神经内科
哈尔滨市中医医院座落于哈尔滨市道里区建国街副270号，她独特的仿古造型，已成为哈市建筑的又一景观。医院占地面积19,850平方米，建筑面积30000平方米。设有门诊楼、医技楼、住院处等，内部设施按国家现代卫生医疗单位结构规划，医院环境优美，布局合理，内部设施齐全，具有完备的消毒隔离条件及污水污物无害化处理设施，是一所科系设备齐全，集医疗、教学、科研为一体的大型综合性的中医医院。拥有固定资产7000万元。医院现有在职职工698名，高、中级专业技术人员是313人。可开放床位630张，有16个医疗科室、11个医技科室、28个专科门诊及专家门诊，日门诊量700人次，年住院人数7000余人次。
第二名黑龙江省医院南岗分院神经内科
黑龙江省医院南岗分院（黑龙江省中日友谊医院）于2001年7月以雄伟壮观的面貌展现在全省人民面前。其前身为黑龙江省医院第一门诊部,始建于1954年。经过全院职工四十七年的艰苦努力,经历从小到大、从弱到强的过程,特别是改革开放给医院注入了生机和活力,现已成为一所省内先进,具有一流服务、一流环境、一流设备、一流管理、专业门类齐全的综合性医院。黑龙江省医院南岗分院设有住院部、门诊部,内设33个临床科室,7个医技科室。有技术精湛、设备先进、在东三省居于领先地位的黑龙江省医院附属消化病医院。
第三名佳木斯市中心医院神经内科
在美丽的松花江畔、素有“东方第一城”之称的佳木斯，矗立着一所拥有63年历史的大型综合性医院——佳木斯市中心医院。医院始建于1950年8月，由最初的地方性战勤医院发展成为黑龙江省东部地区集医疗、科研、教学、预防、保健、康复于一体的大型综合性三级甲等医院。作为省卫生厅确立的佳木斯、双鸭山地区区域医疗中心，承担着两地及周边地区560万群众的医疗保障任务。医院设一部和二部，附设有市医学科学研究所、市医学情报所、市心血管病研究所、友谊社区医疗服务中心。
第四名佳木斯大学第五临床医院神经内科
佳木斯大学第五临床医院位于解放路 218号 （原煤机公司职工医院），建筑面积8000余平方米。拥有员工120人，一分院引进了全国范围内知名的专家担任各专业学科带头人，开设了神经内、外专科、内分泌科、综合内科、骨关节内、外专科等23个临床、医技科室。拥有德国西门子16层螺旋CT、美国博维0.45T核磁共振、法国太空CCD数字摄影机（DR），法国多功能数字胃肠透视机、意大利LC臂大型数字化血管造影...
第五名齐齐哈尔医学院第一附属医院神经内科
齐齐哈尔医学院第一附属医院座落于松嫩平原上的工业重镇、美丽的嫩江西岸—齐齐哈尔市富拉尔基区。　　医院始建于1954年9月，1986年更名为齐齐哈尔医学院第一附属医院。 多年以来，医院秉承老一辈的光荣传统，汲取医疗卫生事业的精髓，励精图治、开拓创新、与时俱进，伴随祖国发展的脚步，走过了近60年的光辉历程。　随着医疗卫生事业改革的不断深入，经全院职工的努力拼搏，医院在办院规模、专业技术、学科建设、教学... [收起]