江苏治疗衣原体感染比较好的三甲医院有1、南京鼓楼医院，2、南京市中西医结合医院，3、江苏省中医院，4、连云港市中医院，5、宿迁市中医院等，衣原体感染属于男科，南京鼓楼医院男科疾病医疗设施齐全，在男科疾病治疗方面有着丰富的经验；南京市中西医结合医院男科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名南京鼓楼医院男科
南京鼓楼医院，又名南京大学医学院附属鼓楼医院，是集医教研为一体的大型综合性三级甲等医院，拥有国家重点学科、国家临床重点专科9个，省临床医学中心4个、省医学重点学科8个、省级临床重点专科29个，省级质控中心5个，省专科、专病诊疗中心8个、市重点专科30个，博士点23个，硕士点32个。
第二名南京市中西医结合医院男科
南京市中西医结合医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、养生为一体的国家公立三级甲等中西医结合医院。医院现有国家、省、市级重点专科、专病16个。中医外科（瘰疬科，骨痨科）、儿科、治未病科为国家中医重点专科，肺外结核病为国家中医重点专病。瘰疬科、妇科、脾胃病科为江苏省中医重点专科，中医疮疡病学为江苏省中医药重点学科。骨伤科、急诊科、肛肠科等为南京市中医重点专科。肺病科、内分泌病科为南京市中医重点专科建设单位。
第三名江苏省中医院男科
江苏省中医院（南京中医药大学附属医院）创建于1954年10月，为全国首批成立的省级中医医院之一，医院共有5名专家入选，4位专家入选2017年首届全国百名名中医，4位专家荣膺国家岐黄学者，成为国内拥有最多国医大师、最多全国名中医的医院。另有25名全国中医师承指导老师、国家级名医传承工作室专家，白求恩奖章获得者2名，中国医师奖获得者2名，享受政府特殊津贴专家37名，有省级名中医、名中西医结合专家60名，江苏省首批国医名师6名。
第四名连云港市中医院男科
连云港市中医院为一所集医疗、急救、教学、科研、康复、养生于一体的三级甲等中医医院，脑病科为国家中医临床重点专科，江苏省中医药重点学科建设项目（中医脑病学）；依托脑病科资源优势，成立了连云港市脑病医院、连云港市脑病诊疗康复中心；针灸科为国家临床重点专科建设项目，是连云港市卫生科技领域目前层次最高的临床重点专科建设项目；肛肠科为江苏省中医临床重点专科；肾病科、结石科为江苏省中医临床重点专科建设单位；心血管病科、骨伤科、脾胃肝胆科、儿科、眼科、泌尿外科、糖尿病、蜂疗等为市中医重点专科和特色专科。
第五名宿迁市中医院男科
宿迁市中医院是市区具有中西医结合特色的中医院,是宿迁市中医药事业医、教、研中心.是市区城镇职工医保和农村新型合作医疗定点单位。全院共有职工260人，其中**职称30人，中级职称102人。设七个病区及一个多功能ICU病房，开放床位210张，正常开展颅脑、胸外、普外、泌尿、骨伤、妇产、微创、介入等大中型手术。骨伤科、肛肠科是医院的重点科室。为加快医院的发展，医院已在运河四号桥东首宿豫新区征地80亩，用于新院建设，新院由江苏省建筑设计院设计，并列入江苏省中医药局“十一五”重点规划建设单位和市、区政府为民办实事重点项目。新的医院总投资1亿元，总建筑面积4万平方米，床位500张，计划2007年底竣工并交付使用。将建设成为宿迁市现代化、园林式、特色化的三级甲等中医院。 [收起]