湖南治疗毛滴虫病比较好的三甲医院有1、中南大学湘雅三医院，2、中南大学湘雅医院，3、永州市中心医院，4、湘西自治州人民医院，5、湘潭市中心医院等，毛滴虫病属于传染科，中南大学湘雅三医院传染科疾病医疗设施齐全，在传染科疾病治疗方面有着丰富的经验；中南大学湘雅医院传染科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名中南大学湘雅三医院传染科
中南大学湘雅三医院（原湖南医科大学附属第三医院）建于1989年，座落在中国历史文化名城长沙，湘江西岸，是国家教育部直属全国重点大学——中南大学附属的大型综合性三级甲等医院，也是国家卫生健康委员会预算管理医院。医院秉承百年“湘雅”精神积淀，以国内一流大学为学科依托，牢牢坚持以人民健康为中心的发展思想，着力打造“以医疗服务为主体，人才培养、科学研究为侧翼，现代医院科学管理为尾翼”的“一体三翼”发展新格局。经过30年的高速发展，医院综合实力大幅提升，成为了一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体，提供高质量医疗服务、培养高层次医学人才、进行高水平科学研究的现代综合医院
第二名中南大学湘雅医院传染科
中南大学湘雅医院（XiangyaHospitalCentralSouthUniversity）创建于1906年，坐落在人文荟萃的楚汉名城长沙，是国家卫生健康委员会直管的三级甲等综合医院，是教育部直属高校中南大学的附属医院，是我国重要的临床诊疗、医学教育与科技创新中心，以精湛的诊疗技术、卓越的科教实力、深厚的文化底蕴享誉海内外。
第三名永州市中心医院传染科
永州市中心医院(全称湖南省永州市中心医院)前身是英国基督教循道会于1905年创办的“普爱医院”，后与中华民国湖南省立零陵医院合并。随着永州的发展，医院经历了零陵专区人民医院、零陵专署人民医院、零陵地区人民医院、永州市人民医院等阶段，目前已发展成一所集医疗、教学、科研、康复、社区医疗、预防保健、医学鉴定于一体的永州市人民政府举办的非营利性三级甲等医院，担负着全市突发性公共卫生事件的紧急救援工作及全市近610万人口的危、急、重症抢救工作，永州市紧急救援中心挂靠我院。
第四名湘西自治州人民医院传染科
湘西自治州人民医院（吉首大学第一附属医院）始建于1952年，是州内唯一集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的国家三级甲等综合医院，现为国家级住院医师规范化培训基地、国家级全科医生转岗培训基地，曾先后被授予全国精神文明先进单位、全国模范职工之家、湖南省文明单位、湖南省职工职业道德建设十佳单位等荣誉称号。
第五名湘潭市中心医院传染科
湘潭市中心医院创建于1900年，其前身是美国长老会开办的“惠景医院”，是湘潭市最早的集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的大型国家三级甲等综合医院，中南大学和南华大学临床教学医院和研究生培养基地。医院编制床位2300张，2017年年门诊量120万余人，住院病人7.2万余人次。医院承担着湘潭市区50％的医疗业务量和90％的急救任务。 [收起]