湖南治疗肛门直肠脓肿比较好的三甲医院有1、湖南省中医院，2、湖南省直中医医院，3、郴州市中医医院，4、郴州市第一人民医院南院区等，肛门直肠脓肿属于肛肠科，湖南省中医院肛肠科疾病医疗设施齐全，在肛肠科疾病治疗方面有着丰富的经验；湖南省直中医医院肛肠科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名湖南省中医院肛肠科
湖南中医药大学第二附属医院，又名湖南省中医院，为国家重点建设中医院。其前身是创建于1934年的湘省国医院，院区所在地为历代祭祀医圣张仲景的祠堂旧址，左邻一代民族英雄辛弃疾屯兵营地。医院历史悠久，是一所综合功能齐全、专科优势突出、中医药特色鲜明的省级综合性三级甲等中医院，素有“湖湘中医发祥地”“医圣故址”之美誉。
第二名湖南省直中医医院肛肠科
医院前身为株洲市中医院，创建于1954年，2005年成建制划转成为省卫生健康委员会（原湖南省卫生厅）直属事业单位，更名为湖南中医药高等专科学校附属第一医院，又名湖南省直中医医院、湖南中医药大学第三附属医院，是省市共建单位，株洲市区唯一省直属医院，是一所集医疗、科研、教学、康复、预防保健和社区医疗服务为一体的大型综合性三级甲等中医综合医院，湖南省卫生健康委、省中医药管理局唯一直属中医院，全国百强中医医院，湖南省域大型综合医院前20强。
第三名郴州市中医医院肛肠科
郴州市中医医院成立于1957年6月，是郴州市唯一一所综合性三级甲等中医医院，是湖南中医药大学和湖南省中医药高等专科学校教学医院，是广东省中医院定点业务指导与协作医院。与我院定点的医保及农合部门有：全国各地城镇职工基本医疗保险；全国各地城乡居民基本医疗保险；湖南省工伤；郴州市生育保险，郴州市工伤与老干；北湖区工伤与老干；苏仙区工伤与老干。
第四名郴州市第一人民医院南院区肛肠科
郴州市第一人民医院建院于1907年，是一所已有百年历史的国家三级甲等综合医院，医院分设中心医院、南院和北院(儿童医院)三个医疗区。中心医院重点为大综合，为郴州市医疗卫生的人才中心、技术中心、设备中心、培训中心;南院是以肿瘤诊治、亚健康干预、生殖医学、康复为发展特色的大专科小综合医院;北院是儿童专科医院，主要担负儿童内科、外科和儿童保健工作任务，是湘南地区唯一的儿童专科医疗保健机构。 [收起]