广东治疗新生儿疾病比较好的三甲医院有1、广州医科大学附属第二医院，2、东莞市妇幼保健院，3、高州市人民医院等，新生儿疾病属于儿科，广州医科大学附属第二医院儿科疾病医疗设施齐全，在儿科疾病治疗方面有着丰富的经验；东莞市妇幼保健院儿科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名广州医科大学附属第二医院儿科
广州医科大学附属第二医院（简称广医二院）于1982年12月正式挂牌，现有编制床位1331张。医院环境优美，学科齐全、技术力量雄厚、专科特色突出。内科学、神经病学为广东省重点学科；外科学、妇产科学、儿科学、临床检验诊断学为广东省重点扶持学科；神经病学为广东省卫生厅重点学科。心血管内科、神经外科、重症医学科、神经内科、急诊科、普通外科、康复科、医学检验科先后被评为广东省临床重点专科，2013年，医院新增胸外科、肾内科、医学影像科、眼科、内分泌科和呼吸内科等6个广东省临床重点专科，疼痛科、过敏反应科被评为国家临床重点专科。
第二名东莞市妇幼保健院儿科
东莞市妇幼保健院始建于1951年，是东莞市唯一一所三级甲等妇幼保健机构，设置了16个职能科室，43个业务科室、12个医疗辅助科室。编制床位980张，实际开放700张；装备了价值3.5亿多元的各类医疗设备，包括3.0T核磁共振、64排螺旋CT、实时四维彩色超声诊断仪、口腔CT、基因测序仪、移动式C型臂X射线机、全数字化乳腺钼钯机、超声聚焦子宫肌瘤治疗系统、血红蛋白毛细管电泳仪等先进设备。
第三名高州市人民医院儿科
高州市人民医院是全国百佳医院,是集医疗、教学、科研、保健、康复为一体的初具现代化规模的综合医院,医院设有25个外科专科、17个内科专科和全国一流水平的肿瘤放射治疗中心,形成个人有专长、科室有特色、全院有优势的专科发展新格局；在华南地区率先开展胸腔镜下房室间隔缺损修补及风湿性心脏病瓣膜置换、微创冠状动脉搭桥、非体外循环下行双向格林术,在粤西地区率先成功开展肝移植手术,还有头盆环牵引治疗重度脊柱弯曲、肾移植等高难度诊疗技术,填补了粤西地区或省内空白,部分项目达到国内先进水平。 [收起]