江苏南京治疗小儿骨软骨瘤比较好的三甲医院有1、江苏省中医院，2、南京市中医院，3、南京市第一医院，4、南京市妇幼保健院，5、南京医科大学附属儿童医院等，小儿骨软骨瘤属于儿科，江苏省中医院儿科疾病医疗设施齐全，在儿科疾病治疗方面有着丰富的经验；南京市中医院儿科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名江苏省中医院儿科
江苏省中医院（南京中医药大学附属医院）创建于1954年10月，为全国首批成立的省级中医医院之一，医院共有5名专家入选，4位专家入选2017年首届全国百名名中医，4位专家荣膺国家岐黄学者，成为国内拥有最多国医大师、最多全国名中医的医院。另有25名全国中医师承指导老师、国家级名医传承工作室专家，白求恩奖章获得者2名，中国医师奖获得者2名，享受政府特殊津贴专家37名，有省级名中医、名中西医结合专家60名，江苏省首批国医名师6名。
第二名南京市中医院儿科
南京市中医院成立于1956年，是一所中医特色明显、中西医结合、集医疗服务功能和急救能力为一体的三级甲等中医院。设有临床及医技科室38个，其中国家级重点学科：中医肛肠病学，国家级重点专科7个；江苏省重点学科：中医脑病学，江苏省重点专科8个，南京市中医重点专科14个。
第三名南京市第一医院儿科
南京市第一医院（南京医科大学附属南京医院、中国药科大学南京市第一医院），是卫生部首批三级甲等综合性医院。现有国家重点学科1个，国家临床重点专科1个，江苏省医学重点学科4个，江苏省专科（病）诊疗中心1个，南京医科大学重点学科4个，江苏省省级临床重点专科20个，南京市医学重点学科2个，南京市医学重点专科8个，博士培养点14个，硕士培养点30个，国家级博士后科研工作站1个，院士工作站6个。
第四名南京市妇幼保健院儿科
南京市妇幼保健院创建于1936年，为南京医科大学附属妇产医院、国家级爱婴医院、省内首家三级甲等妇幼保健院，医院学科体系完善，其中腔镜科为卫生部四级妇科内镜手术培训基地，中医科为全国综合医院中医药工作示范单位，产科、产前诊断研究室、新生儿科、妇科、麻醉科、中医科为省级临床重点专科，儿童保健科、妇女保健科、乳腺科、检验科、超声诊断科为市级临床重点专科，妇女保健科、儿童保健科、生殖医学、计划生育、乳腺病学为第二周期省妇幼保健重点学科。
第五名南京医科大学附属儿童医院儿科
南京医科大学附属儿童医院（江苏省儿童医学中心、南京市儿童医院）是一所集医疗、科研、教学、康复、保健为一体的大型综合性三级甲等儿童医院。拥有26个临床专科，其中1个国家级临床重点专科、12个省级临床重点专科、14个市级临床重点专科、2个省“科教强卫工程”医学重点学科、1个省“科教强卫工程”医学创新团队、1个省妇幼重点学科。 [收起]