广东治疗小儿营养不良比较好的三甲医院有1、广东省第二中医院，2、广州医科大学附属第二医院，3、北京大学深圳医院，4、广东省中西医结合医院，5、佛山市中医院等，小儿营养不良属于中医科，广东省第二中医院中医科疾病医疗设施齐全，在中医科疾病治疗方面有着丰富的经验；广州医科大学附属第二医院中医科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名广东省第二中医院中医科
广东省第二中医院（广东省工程技术研究院）始建于1993年，是广东省卫生厅和省中医药局直属的综合性省级中医医疗机构，是广州市急救医疗网络（120）单位、医保定点三级甲等医院、广东省高等医学院校教学医院、广州中医药大学附属医院、香港大学实习医院、国家药物临床试验机构、广东建设中医药强省中医名院建设单位。医院注重发挥中医药特色优势，传承中医药理论和方法，形成了特色鲜明、疗效显著的专病专科30多个。其中中医心病学、针灸康复学及中医药工程技术学已被评为国家级重点学科。心血管科、脑病科、骨伤科、肿瘤科、护理及临床药学等7个专科被评为国家级重点专科。脾胃病、呼吸、内分泌、妇科、外科等为省级重点专科（专病）。
第二名广州医科大学附属第二医院中医科
广州医科大学附属第二医院（简称广医二院）于1982年12月正式挂牌，现有编制床位1331张。医院环境优美，学科齐全、技术力量雄厚、专科特色突出。内科学、神经病学为广东省重点学科；外科学、妇产科学、儿科学、临床检验诊断学为广东省重点扶持学科；神经病学为广东省卫生厅重点学科。心血管内科、神经外科、重症医学科、神经内科、急诊科、普通外科、康复科、医学检验科先后被评为广东省临床重点专科，2013年，医院新增胸外科、肾内科、医学影像科、眼科、内分泌科和呼吸内科等6个广东省临床重点专科，疼痛科、过敏反应科被评为国家临床重点专科。
第三名北京大学深圳医院中医科
北京大学深圳医院原名深圳市中心医院，是深圳市政府投资建成的现代化综合性医院。开设52个临床医技科室，其中1个国家级合作重点学科、8个省级临床重点医学专科、1个省级重点实验室、8个市级重点学科及实验室。医院开展的一大批医学高新技术和特色服务项目，吸引了深圳、香港、澳门以及周边地区的大批患者，还有来自全球36个国家和地区的外宾前来就诊。
第四名广东省中西医结合医院中医科
广东省中西医结合医院创建于1993年，是一家集临床、教学、科研、健康、保健、康复科学于一体的三级甲等中西医结合医院，设有急诊、ICU、内科、外科、骨科、妇科、儿科、康复科、麻醉手术科、肿瘤科、口腔科、皮肤科等一级临床科室13个，心血管、肾内、内分泌、神经内、呼吸、消化、感染、普外、神经外、肛肠、泌外、耳鼻喉、眼科、手足外等二级临床科室13个，开设专科专病47种。年门诊量达130多万人次，出院病人2.2万人次。
第五名佛山市中医院中医科
佛山市中医院设有骨伤科、内科、急诊、ICU、外科、妇科、针灸科等46个临床科室和9个其他医技科室，设有骨伤科研究所、中医药研究室，拥有国家中医药二级实验室2个，各类专科专病门诊116个。医院骨伤科、脑病科、糖尿病科、肿瘤科被评为国家中医药管理局十二五重点专科和建设单位，10个专科被评为广东省中医药局重点专科和建设单位，另有3个市级特色专科。 [收起]