北京治疗扁平疣比较好的三级医院有1、北京老年医院，2、北京电力医院，3、北京小汤山医院，4、大兴人民医院，5、首都医科大学附属北京潞河医院等，扁平疣属于中医科，北京老年医院中医科疾病医疗设施齐全，在中医科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京电力医院中医科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京老年医院中医科
北京老年医院是市属三级医院、是北京中医药大学附属医院。医院担负着老年人急诊医疗、急性后期康复、临终关怀、慢病管理和健康体检等任务;是北京市老年卫生服务指导中心，承担全市医护人员老年医学的培训任务;是北京老年健康服务体系建设的龙头单位，也是全国老年医院联盟理事长单位。
第二名北京电力医院中医科
 国家电网北京电力医院是时任国务院总理李鹏同志关怀下建立起来的，于1989年正式开院，隶属国家电网公司。是一所集医疗、教学、科研、预防、健康管理等为一体的三级综合医院，是首都医科大学教学医院、中国企业医院协会副主委单位，是北京市医疗保险定点单位和新农合定点医院。医院新大楼于2013年10月8日正式启用，拥有26个临床医技科室，49个专业，已经形成了学科门类齐全的丰台区最大的三级综合医院。其中有心内...
第三名北京小汤山医院中医科
北京小汤山医院又名北京小汤山疗养院、北京小汤山康复医院、北京国际药膳博物馆。设有各种室内水疗、体疗、理疗、康复、健身等系列医疗康复保健项目，可提供健康管理、健康体检、门诊就医、住院治疗、健康疗养、综合康复、科学健身、会议接待等多种服务。其中门诊部设有内科、外科、妇产科、耳鼻喉科、眼科、口腔科、皮肤科、康复医学科、中医科等临床科室及机能科、检验科、放射科药剂科等辅助科室，住院部分为综合内科、外科及康复中心。
第四名大兴人民医院中医科
 　　一、概况　　北京市大兴区人民医院始建于1954年，历经50余年风雨沧桑，现为京南集医、教、研、防为一体的二级甲等医院，直接服务于大兴区人民，并辐射广大周边地区。 　　2006年我院被北京市医保中心评为医保A类医院。2006年8月28日，伴随着新住院病房楼的正式启用，我院成为首都医科大学燕京医学院附属大兴医院(简称首都医科大学大兴医院)。成为北京市内、外科和全科医师培训基地...
第五名首都医科大学附属北京潞河医院中医科
首都医科大学潞河教学医院始建于1878年，是一家有着130余年历史的医院，医院占地面积60亩，正在建设的门诊综合楼建成后建筑面积达11万多平方米。医院现有员工2300余人，设有27个临床科室，20个科室三级专业分科已发展成熟，7个科室在2013年已经完成三级专业分科。全院有26项医疗技术项目达到国际先进水平，90％的技术项目达到三甲医院水平，100％达到三级医院水平。 [收起]