湖南治疗甲状腺囊肿比较好的三甲医院有1、湖南省中医院，2、中南大学湘雅三医院，3、邵阳市中心医院，4、娄底市中心医院，5、怀化市第一人民医院等，甲状腺囊肿属于内分泌科，湖南省中医院内分泌科疾病医疗设施齐全，在内分泌科疾病治疗方面有着丰富的经验；中南大学湘雅三医院内分泌科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名湖南省中医院内分泌科
湖南中医药大学第二附属医院，又名湖南省中医院，为国家重点建设中医院。其前身是创建于1934年的湘省国医院，院区所在地为历代祭祀医圣张仲景的祠堂旧址，左邻一代民族英雄辛弃疾屯兵营地。医院历史悠久，是一所综合功能齐全、专科优势突出、中医药特色鲜明的省级综合性三级甲等中医院，素有“湖湘中医发祥地”“医圣故址”之美誉。
第二名中南大学湘雅三医院内分泌科
中南大学湘雅三医院（原湖南医科大学附属第三医院）建于1989年，座落在中国历史文化名城长沙，湘江西岸，是国家教育部直属全国重点大学——中南大学附属的大型综合性三级甲等医院，也是国家卫生健康委员会预算管理医院。医院秉承百年“湘雅”精神积淀，以国内一流大学为学科依托，牢牢坚持以人民健康为中心的发展思想，着力打造“以医疗服务为主体，人才培养、科学研究为侧翼，现代医院科学管理为尾翼”的“一体三翼”发展新格局。经过30年的高速发展，医院综合实力大幅提升，成为了一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体，提供高质量医疗服务、培养高层次医学人才、进行高水平科学研究的现代综合医院
第三名邵阳市中心医院内分泌科
医院创建于1946年，经过半个多世纪的建设和发展，现已成为湘西南的一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的地市级综合医院。1993年被卫生部首批列入全国500所大型医院，1997年晋升为国家三级甲等医院。1999年被评审通过为湖南省普通高等医学院校临床教学优秀基地，现为南华大学附属医院。2011年被卫生部确定为国家级湘西南区域医疗中心，2011至2016年连续6年强势挺进“全国最有竞争力地市级医院100强”行列。邵阳市中心医院的规模日益扩大，科系齐全，技术力量雄厚。现有编制床位1400张，在职职工2300余人，拥有各类专业技术人员近1600人，其中有高级职称达300余人。
第四名娄底市中心医院内分泌科
娄底市中心医院始建于1977年，原名娄底地区人民医院，是娄底唯一一所集医疗、科研、教学、预防与保健为一体的国家三级甲等综合性医院、全省五大区域医疗中心之一。医院占地10万余平米，现有在职职工2679人，其中副高以上专家483人，中级专技人员750余人，享受省政府特殊津贴专家2名，吉首大学、南华大学硕士研究生导师10人，博士、硕士460余名。医院编制床位1800张，实际开放病床2800余张。医院设有59个病区、70余个医疗医技科室和全省首家三甲综合医院院士工作站、湘中3D医学打印中心、临床医学研究中心、遗传、胚胎移植等多个实验研究中心。
第五名怀化市第一人民医院内分泌科
成立于1970年的怀化市第一人民医院，前身为湖南省铁路工程指挥部医院、怀化地区第一人民医院，是湖南西部集医疗、科研、教学、康复、预防于一体的大型三级甲等综合医院，全国百佳医院、全国百姓放心示范医院，系南华大学附属怀化医院、南华大学怀化临床学院，南华大学和吉首大学硕士学位培养点，吉首大学附属第四医院和吉首大学第四临床学院，国家住院医师规范化培训基地，国家全科医生规范化培训和转岗培训基地，国家卫计委脑卒中筛查与防治基地医院，国家卫计委脑防委在建高级卒中中心，湖南省住院医师规范化结业考核考点，湖南省感染性疾病、急危重症疾病临床医疗技术示范基地，湖南省胸痛中心首批试点医院，怀化市高危孕产妇抢救中心。 [收起]