针灸科始建于五十年代，是云南省最早的针灸科，经过四十多年的发展和完善，形成了独特的治疗特色，是云南省针灸重点专科，云南省中医名科。现有高级职称11人，博士2人，硕士研究生导师5人，特聘国家级名中医王光鼎教授、张沛霖教授指导临床诊疗工作。针灸科是云南省及外国留学生、针灸临床硕士生等针灸人才培养基地，有国家级、省厅级科研课题二十余项，是云南省集医教研为一体的具有较强技术力量的针灸科室。在疾病治疗上，突出针灸特色，应用中西医结合的治疗方法，以准确的诊断及治疗，为患者提供全方位的优质医疗服务。“关爱病人，疗效至上”是我们一贯的服务宗旨。
针灸是中国传统医学的奇葩，属于中医的一种特殊外治方法，它是采用不同的针具刺激人体的一定部位，应用各种方法激发人体的经气，以调整人体的功能，从而达到治疗疾病的目的。针灸科开展的传统治疗有：传统针刺、艾灸、天灸、温针、头针、耳针、舌针、项针、颈针、拔罐、穴位注射、穴位封闭、穴位激光照射、穴位埋针、三棱针刺血，中药外敷熏蒸。
针灸科有40张病床，采用针灸传统治疗手段，充分利用针灸治疗疾病的优势，特别在脑病及神经康复方面，集中医和现代医学先进治疗手段为一体，配备现代化康复器材，能为中风等脑病患者提供更为全面疗效更佳的康复治疗。康复方面的治疗方法有作业、物理、语言治疗及相关理疗设备等。
治疗范围：
一、脑病及创伤康复：中风及其后遗症(脑血栓、脑梗塞、脑出血)，脑炎及脑外伤后遗症，脑血管性痴呆，脑供血不足，脑萎缩，记忆力低下，早衰，帕金森综合症 ，舞蹈症，脊髓损伤，运动及外伤所致的各种损伤。
二、神经系统病症：面神经麻痹(面瘫)，三叉神经痛(面痛)，面肌痉挛，失眠，带状疱疹，郁症，神经衰弱，癔病，神经官能症，植物神经功能紊乱，多发性神经炎，痿证(肢体萎软无力和肌肉萎缩、侧索硬化、重症肌无力、肌营养不良症、小儿麻痹后遗症等)，癫痫，桡、尺、腓总、胫神经麻痹。
三、骨与关节病症：腰痛(腰椎间盘突出症、腰肌劳损)，骨质疏松症，痹证(颈椎病、颈肩腰腿痛及关节疼痛麻木或不温、风湿性或类风湿性关节炎、坐骨神经痛)、扭伤(附：腰扭伤及其他关节扭伤和落枕)，劳损(附：老年性骨关节炎)，肘劳(附：肱骨外上髁炎)，肩周炎。
四、内科病症：眩晕(附：高血压)，失眠，头痛，痛风，疲劳综合症，冠心病，感冒，咳嗽，哮喘，呕吐，胃痛，呃逆(打嗝)，腹痛，便秘，脱肛(附：胃下垂及子宫脱垂)，小便不利及遗尿(附前列腺炎)，水肿，遗精(附：阳痿、男性不育)。
五、妇儿科病症：月经不调，更年期综合症，急慢性盆腔炎、附件炎，痛经，经闭，崩漏，胎位不正，乳少，子宫脱垂，不孕，经行乳房胀痛，妊娠呕吐，阴痒，阴道炎，疳积(附小儿厌食及消化不良)，小儿食积，小儿脑瘫，小儿多动症。
六、皮外科病症：过敏性疾病，神经性皮炎，痤疮，斑秃(附：脱发)，风疹(皮肤瘙痒)。
七、五官科病症：近视，眼干眼涩，暴盲(附：视神经萎缩)，斜视，眼睑下垂，耳鸣，耳聋，牙痛(附：牙周炎、龋齿)，鼻渊(急、慢性鼻炎、鼻窦炎、过敏性鼻炎)，咽喉肿痛(急慢性咽炎、声音嘶哑)，口疮(口腔溃疡)。
八、 痛证：头痛，颈肩腰腿痛，痛经，胃痛等各种疼痛性疾病，乃至癌性疼痛。
九、美容美形：减肥，戒烟，美容，延缓衰老。
十、其他：各种疑难杂症。
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