职业病科在1988年建院之初就成立了，同时设有职业病教研室及职业病的专用实验室，此外医院与职业病诊治相关科室有：放射科、呼吸科(与尘肺诊断)、眼科(参与放射性眼病的诊断)、五官科(参与物理因素燥音对人体危害的诊断)、皮肤科及预防保健处等，它们都有明确的职业病工作范围和任务：放射性职业病的诊治?主要面向核工业集团公司所属厂、矿、核电站、核设施、研究院、所的核辐射事故的医学应急救援。处理过的放射性损伤包括：急、慢性放射病及放射性皮肤损伤诊治，过量受照人员的医学处理，辐射损伤远后期效应的随访等。尘肺的诊治?核工业尘肺诊断以及地方尘肺诊治，病房收治病情较重的矽肺及并发症的病人，职业中毒的诊治?主要针对核工业厂矿，如铅、汞、锰、苯、TNT、一些高分子化合物及其它有毒有害化学物质的防治工作。核电和核设施操纵员及放射性工作人员的职业健康监护是科室一项重要工作，每年数次到各地核电站进行健康监护与评价。
职业病科有较完善的职业病诊断实验室及相关的仪器设备?职业病实验室与核工业辐射损伤医学应急中心兼容，设在应急中心大楼内。辐射生物、辐射遗传学、洁净实验室、开展放射血液、免疫、细胞遗传、内分泌等方面的诊断和科研工作。
职业病科是辐射损伤救治的专门化科室，因而对核工业的一、二级医院每年有1~2期医学应急培训任务，指导一、二级医院的辐射损伤救治任务，同时担任苏州大学放射医学本科班的教学任务。
职业病科特色：职业健康监护，职业健康心理测试，职业病的诊断，职业病的治疗，辐射损伤剂量估算及受照人员的染色体及微核检查，职业中毒的现场检测、救治及诊断和治疗。
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