福建治疗眼科疾病比较好的三级医院有1、厦门科宏眼科医院，2、福州东南眼科医院；厦门科宏眼科医院眼科疾病医疗设施齐全，在眼科疾病治疗方面有着丰富的经验；福州东南眼科医院眼科疾病医疗储备人员丰富，对眼科疾病有着独到的见解和优势。