全国治疗蹼状阴茎比较好的三甲医院有1、海南省中医院，2、上海市第六人民医院东院，3、北京大学肿瘤医院，4、合肥市第一人民医院滨湖医院，5、昆明医科大学第二附属医院等，蹼状阴茎属于男科，海南省中医院男科疾病医疗设施齐全，在男科疾病治疗方面有着丰富的经验；上海市第六人民医院东院男科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名海南省中医院男科
海南省中医院始建于1954年，是一所集医疗、科研、教学、预防、保健、康复于一体的综合性三级甲等中医医院，是广州中医药大学附属医院（非直属）。医院目前编制床位900张，实际开放床位665张。现有在册人员1037人，设有临床科室24个，医技科室10个,门诊部3个。医院人才荟萃，拥有一批包括国家特贴专家、全国名中医、全国老中医药专家、省优秀专家在内的中医药专家，有高级职称124人，中级职称191人，博士硕士96名。医院还“软”引进了包括国医大师石学敏院士在内的权威中医名家33名，极大地提升了医院的综合实力。
第二名上海市第六人民医院东院男科
上海市第六人民医院东院、上海交通大学附属第六人民医院东院拥有省部级以上重点学科（专科）（骨科、内分泌代谢学科、耳鼻咽喉科、医学影像学科）列为重点学科，同时注重发展具有区域特色的学科及专业，6个院级特色学科（肿瘤内科、神经外科、麻醉科、心血管内科、呼吸内科、妇产科）。建立了以重点学科、特色学科、专业学科为梯度结构的学科建设基本框架，明确未来几年的学科发展方向。
第三名北京大学肿瘤医院男科
北京大学肿瘤医院设有34个临床科室，14个医技科室，17个基础研究科室,开放床位776张。全年门诊量66万人次，年收治病人7.8万人次，手术近1.6万例。医院职工近2400人，在编职工中正高级职称124人，副高级职称211人。 北京大学肿瘤医院有国家重点学科1个(肿瘤学)、国家临床重点专科2个(肿瘤科、病理科)、北京市重点学科4个(北京市胃癌防治中心、北京市乳腺癌防治中心、北京市影像介入治疗中心、超声诊断中心)、北京市中医管理局重点学科1个(中西医结合科暨老年肿瘤科)，全国名老中医药专家传承工作室1个，北京学者工作室1个，是恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室、恶性肿瘤转化研究北京市重点实验室。
第四名合肥市第一人民医院滨湖医院男科
合肥市滨湖医院位于合肥市滨湖新区，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等于一体的非营利性、三级医院规模的现代化综合性医院。开设了42个临床科室、17个医技科室。拥有重点学科20个，其中护理学为国家临床重点专科，呼吸内科、医学影像科、药学科、检验科为省“十二五”临床医学重点培育学科，肛肠科为省“十二五”中医重点专科，骨科、普外科、重症医学科、护理学、影像医学科、药学科、检验科为合肥市临床医学重点学科，儿科、神经内科、心血管内科为合肥市临床医学重点扶持学科，口腔颌面外科为合肥市临床医学特色专科，药理学、影像医学与核医学为安徽医科大学重点学科，普外科为安徽医科大学重点扶持学科。
第五名昆明医科大学第二附属医院男科
昆明医科大学第二附属医院（昆医大附二院）建院于1952年10月，原名为昆明市工人医院。医院科室齐全，学科优势突出，设有肝胆胰外科、泌尿、康复医学、烧伤、重症医学、骨科、微创、护理、消化、血液、神经内科等学科，医院现有62个临床和医技科室，2个国家临床重点专科建设项目，16个省级临床重点专科建设项目。 [收起]