上海治疗小儿两性畸形比较好的三甲医院有1、复旦大学附属中山医院，2、复旦大学附属眼耳鼻喉科医院，3、上海交通大学医学院附属仁济医院，4、上海市第七人民医院，5、复旦大学附属儿科医院等，小儿两性畸形属于整形美容，复旦大学附属中山医院整形美容疾病医疗设施齐全，在整形美容疾病治疗方面有着丰富的经验；复旦大学附属眼耳鼻喉科医院整形美容口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名复旦大学附属中山医院整形美容
复旦大学附属中山医院是国家卫生和计划生育委员会预算管理单位，是复旦大学的附属综合性教学医院。医院开业于1937年，是当时中国人管理的第一所大型综合性医院，隶属于国立上海医学院，医院设有除儿科以外的所有科室、综合实力雄厚。心脏、肝癌、肾脏和肺部疾病诊治是医院的重点和特色，诊治水平始终处于国内领先地位。国家临床重点专科18个：消化科、检验科、麻醉科、心血管内科、内分泌科、胸外科、心脏大血管外科、临床护理、中医脑病科、呼吸内科、肾病科、普通外科、重症医学科、肿瘤科、医学影像科、器官移植科、急诊医学科和神经内科。心血管病和肝肿瘤为上海市临床医学中心。
第二名复旦大学附属眼耳鼻喉科医院整形美容
复旦大学附属眼耳鼻喉科医院坐落于徐汇区汾阳路83号。医院由国家一级教授胡懋廉、郭秉宽等创办于1952年，创办时名为上海医学院眼耳鼻喉科学院。2000年上海医科大学与复旦大学合并后更为现名。如今是全国范围内唯一一所集眼科和耳鼻喉科医疗、教学、科研为一体的三级甲等专科医院。2006年获得第二冠名——上海市五官科医院，亦为上海市红十字冠名医院、国家临床药物实验机构。医院占地33亩，实际开放床位374张，设有眼科、耳鼻喉科、放疗科、麻醉科、急诊科、口腔科、激光整形科、护理八个临床科室和放射、病理、药剂、
第三名上海交通大学医学院附属仁济医院整形美容
上海仁济医院建于1844年,是上海开埠后第一所西医医院。医院目前由东西南北四个院区和上海市肿瘤研究所组成,是一个学科门类齐全,集医疗、教学、科研于一体的综合性三级甲等医院。医院设有42个临床医技科室：消化科、心内科、血液科、风湿病科、老年病科、呼吸科、肾脏科、神经内科、内分泌科、肿瘤科、康复科、急诊科、核医学科、放射诊疗科、泌尿科、普外科、骨科、心血管外科、胸外科、血管外科、神经外科、肝脏外科、整形外科、麻醉科、中医科、儿科、眼科、妇产科、生殖医学科、耳鼻咽喉-头颈外科、皮肤科、感染科、口腔科、营养科、放射科、超声医学科、病理科、检验科、药剂科、输血科、内科门诊、健康保健中心。
第四名上海市第七人民医院整形美容
上海市第七人民医院位于浦东新区外高桥区域，紧邻上海自由贸易试验区，是集医疗、科研、教学为一体、康复、健康管理为特色的三级甲等中西医结合医院，4次被评为卫生部先进集体，11次被评为上海市文明单位。医院重点学科建设卓有成效，拥有国家中医药管理局“十二五”重点专科肾病科；上海市医学重点专科康复科、上海市中医临床优势专科康复科、上海市中医临床重点学科中医肿瘤病学、上海市中西医结合重点病种湿疹、上海市传统医学示范中心；浦东新区重点学科临床药学、浦东新区重点学科群中西医结合康复医学学科群、浦东新区传统型中医临床示范学科中医肛肠科、浦东新区重点专科耳鼻咽喉科、浦东新区重点专科核医学科、浦东新区重点专科泌尿外科、浦东新区传统型中医临床示范学科中医男性科；并于2013年成立了健康管理部、脊柱外科。
第五名复旦大学附属儿科医院整形美容
复旦大学附属儿科医院创建于1952年，由西门妇孺医院分院、中国红十字会第一医院儿科和中山医院儿科合并而成，原名上海第一医学院附属儿科医院，医院专业设置齐全，共有45个临床医技科室，2010年、2011年、2013年先后有7个专科被确定为国家临床重点专科，包括：新生儿、重症医学科、小儿消化科、中医儿科、新生儿疾病重点实验室、临床护理、小儿外科。新生儿、外科、心血管、传染病等专业曾先后被列为卫生部临床学科重点专业，新生儿科是上海市医学重点学科，儿科学是上海市重中之重重点学科，小儿外科是上海市小儿外科疑难重症临床医学中心，呼吸急救专业是上海市医学领先专业。 [收起]