北京西城治疗卵巢囊肿比较好的三甲医院有1、首都医科大学宣武医院，2、北京中医药大学附属护国寺中医医院，3、首都医科大学附属北京友谊医院，4、北京市回民医院，5、北京大学第一医院等，卵巢囊肿属于妇科，首都医科大学宣武医院妇科疾病医疗设施齐全，在妇科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京中医药大学附属护国寺中医医院妇科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名首都医科大学宣武医院妇科
首都医科大学宣武医院创建于1958年，是一所以神经科学和老年医学的临床与研究为重点，以治疗心脑血管疾患为特色，承担医疗、教育、科研、预防、保健和康复任务的大型三级甲等综合医院。是新中国神经科学的初创基地和培育神经科学人才的摇篮之一,在国内有着重要学术地位。受国家卫生部委托，医院承办全国神经内科医师进修班、神经外科医师进修班、神经放射医师进修班，是国家级继续医学教育培训基地。
第二名北京中医药大学附属护国寺中医医院妇科
护国寺中医医院是北京市最早的公立中医医疗机构。早在六十年代，就作为北京中医学院(现北京中医药大学)的教学、实习医院，医院开设有内、外、针灸、肿瘤、骨科8个病区;门诊设有内、外、针、骨、妇、儿、皮、眼、五官、口腔、急诊及放射、CT、检验、心电、超声、心脑功能捡查、手术室、中西药房、中西药制剂等科室20余个;有普通门诊、专家门诊为患者提供优质服务，全国著名中医内科专家许彭龄教授等众多专家定期应诊。
第三名首都医科大学附属北京友谊医院妇科
首都医科大学附属北京友谊医院原名为北京苏联红十字医院，始建于1952年。医院设有北京市临床医学研究所、北京热带医学研究所、北京市中西医结合研究所和北京市卫生局泌尿外科研究所，拥有一批学科带头人和技术骨干。胃肠肝胆胰疾病诊治、泌尿系统疾病诊治和肾移植、热带病和寄生虫病诊治以及中西医结合是医院的四大专业特色。内科学(消化系病)是国家重点(培育)学科;消化内科、临床护理、地方病(热带医学)、普通外科、重症医学科、老年病科、检验科、病理科获批国家临床重点专科。
第四名北京市回民医院妇科
北京市回民医院创建于1947年，原名“中国回教协会普慈施医院” ，是一所以现代医学为主，集医疗、预防、保健、康复、健康教育、社区服务为一体的二级甲等综合医院，有开展中医治疗重症肌无力特色门诊，有针灸、推拿、中药、药浴、熏蒸等多项综合诊疗法。
第五名北京大学第一医院妇科
北京大学第一医院(北大医院)位于北京老皇城内，是距离中南海最近的医院，是一所融医疗、教学、科研、预防为一体的大型综合性三级甲等医院。拥有着一批国内的首创专业学科以及在我国率先开展的诊疗技术，如国内首创小儿科(1940)、泌尿外科、肾脏病专业、综合医院心血管病房、小儿神经专业等。 [收起]