广东治疗胃肠道间质瘤比较好的三甲医院有1、广州中医药大学第一附属医院，2、南方医科大学珠江医院，3、宝安区人民医院，4、深圳市中医院，5、广州医科大学附属肿瘤医院等，胃肠道间质瘤属于肿瘤科，广州中医药大学第一附属医院肿瘤科疾病医疗设施齐全，在肿瘤科疾病治疗方面有着丰富的经验；南方医科大学珠江医院肿瘤科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名广州中医药大学第一附属医院肿瘤科
广州中医药大学第一附属医院是一所大型综合性中医医院，创建于1964年，是我国高等中医药临床教育、医疗、科研重要基地之一，为全国首批三级甲等中医医院、示范中医医院和首批广东省中医名院。医院拥有卫生部国家临床重点专科7个（内分泌科、耳鼻喉科、骨伤科、脾胃病科、妇科、肿瘤科、临床药学）、国家中医药管理局重点专科14个（急诊科、内分泌科、耳鼻喉科、骨伤科、肿瘤科、妇科、心血管科、针灸科、脾胃病科、脑病科、风湿病科、重症医学科、护理学、临床药学），已进入国家重点专科专病单位数量最多的医院行列，其中多个专科专病成为全国协作组组长或副组长单位；拥有省级重点专科专病27个。
第二名南方医科大学珠江医院肿瘤科
珠江医院是南方医科大学（原第一军医大学）第二附属医院、第二临床医学院，创建于1947年，编设65个专业科室、35个教研室，拥有国家临床医学一级学科博士学位授权学科、博士后科研流动站，国家级、省级临床重点专科23个、国家重点培育学科1个、国家中医药管理局重点学科1个、国家级培训基地10个、广东省医疗质量控制中心2个。
第三名宝安区人民医院肿瘤科
　　深圳市宝安人民医院（又名深圳市第八人民医院）是国家三级甲等综合医院。始建于1984年，是一家集医疗、预防、保健、康复、科研、教学于一体的大型综合医院，是南方医科大学非直属医院，广东省高等医学院校教学医院，住院医师规范化培训基地，中山大学博士后流动站科研基地。医院占地面积6.3万平方米，建筑面积14.4万平方米，开设病床1050张，有固定资产7.6亿元，其中仅MRI、直线加速器、64排螺旋CT、...
第四名深圳市中医院肿瘤科
深圳中医院于1975年成立,座落于深圳市福田区中心区,拥有建设单位2个(骨伤科、脾胃专科);市级重点医学专科4个。有国家二级实验室一所分子生物学实验室。在研课题100余项。先后中标国家自然科学基金科研课题6项、广东省自然科学基金科研课题4项,国家中医药管理局科研课题7项。
第五名广州医科大学附属肿瘤医院肿瘤科
广州医科大学附属肿瘤医院是广州市唯一一所集医、教、研为一体的市属专科肿瘤医院，设有肺肿瘤外科、食管纵膈肿瘤外科、乳腺科、胃肠肿瘤外科、肝胆肿瘤外科、神经外科、头颈肿瘤外科、泌尿肿瘤外科、妇科肿瘤科、介入病区、肿瘤内科、血液肿瘤科、中西医结合科、中医科、放疗科、重症医学科及麻醉科等22个临床科室，并配有放疗中心、放射科、检验科、输血科、超声诊断科、内窥镜室、病理科、核医学科、新技术治疗中心、生物治疗中心、药剂科等12个医技科室。 [收起]