北京治疗单纯性甲状腺肿比较好的三甲医院有1、北京中医药大学东直门医院东区，2、中国人民解放军火箭军总医院，3、北京市丰台中西医结合医院，4、北京医院，5、北京大学第一医院等，单纯性甲状腺肿属于内分泌科，北京中医药大学东直门医院东区内分泌科疾病医疗设施齐全，在内分泌科疾病治疗方面有着丰富的经验；中国人民解放军火箭军总医院内分泌科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京中医药大学东直门医院东区内分泌科
北京中医药大学东直门医院东区(原北京市通州区中医医院)坐落于北京的东大门, 始建于1982 年，目前拥有专业技术人员557人，高级职称60人，中级职称152人，研究生78人，博士生8人。科室齐全，设心病科、脑病科、康复科、内分泌科、脾胃病科、肺病科、外科、妇科、肛肠科、骨伤科等二十余个科室，拥有国家级重点专科3个，为脑病科、肺病科、心病科。针灸推拿科为北京特色专科，区级重点专科3个。
第二名中国人民解放军火箭军总医院内分泌科
医院位于北京市西城区新街口外大街16号，占地59亩，展开床位1100张，展开科室55个。拥有全军医学专科和专病中心5个（全军肝胆胃肠病专科中心、全军肛肠病专病中心，全军核辐射损伤医学监测与防治研究中心，全军脑卒中医疗救治研究中心、全军心理卫生指导中心），火箭军医学专科和专病中心10个；国家药物临床试验机构专业5个，博士后科研工作站1个。
第三名北京市丰台中西医结合医院内分泌科
北京市丰台区长辛店医院建于1975年3月，是一所集医疗、预防、康复、科研、教学为一体的综合性二级医院。拥有25个临床科室、10个医技科室。在岗职工576人，其中专业技术人员487人，副高以上职称57人，医学硕士、博士(博士后)共90人，国家级名老中医传承人1人，市级名老中医传承人1人，区级名老中医传承人3人，院级名老中医传承人8人。
第四名北京医院内分泌科
 　　北京医院的前身是德国医院，始建于1905年。现为国家卫生计生委直属的三级甲等医院，是中央的干部保健基地。北京医院是一所以高干医疗保健为中心、老年医学研究为重点 、向社会全面开放的融医疗、教学、科研、预防为一体的现代化大型综合性医院。 　　北京医院位于北京市中心，毗邻长安街、崇文门、台基厂、东交民巷。占地面积55800多平方米，建筑面积227788多平方米，现有床位1100张，职工2673人。...
第五名北京大学第一医院内分泌科
北京大学第一医院(北大医院)位于北京老皇城内，是距离中南海最近的医院，是一所融医疗、教学、科研、预防为一体的大型综合性三级甲等医院。拥有着一批国内的首创专业学科以及在我国率先开展的诊疗技术，如国内首创小儿科(1940)、泌尿外科、肾脏病专业、综合医院心血管病房、小儿神经专业等。 [收起]