北京治疗肥胖症比较好的三甲医院有1、北京协和医院，2、北京301医院，3、北京中医药大学东直门医院东区，4、北京市第一中西医结合医院，5、中国中医科学院广安门医院等，肥胖症属于内分泌科，北京协和医院内分泌科疾病医疗设施齐全，在内分泌科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京301医院内分泌科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京协和医院内分泌科
北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担高干保健和外宾医疗任务的医院之一，也是高等医学教育和住院医师规范化培训国家级示范基地，临床医学研究和技术创新的国家级核心基地。以学科齐全、技术力量雄厚、特色专科突出、多学科综合优势强大享誉海内外。在复旦大学医院管理研究所公布的“中国医院排行榜”中连续十年名列榜首。
第二名北京301医院内分泌科
中国人民解放军总医院（301医院）创建于1953年，是集医疗、保健、教学、科研于一体的大型现代化综合性医院。设置165个临床、医技科室，233个护理单元，拥有8个国家重点学科、1个国家重点实验室、20个省部级及全军重点实验室、33个全军医学专科中心和研究所，形成了以综合诊疗为特色的13项专业优势。
第三名北京中医药大学东直门医院东区内分泌科
北京中医药大学东直门医院东区(原北京市通州区中医医院)坐落于北京的东大门, 始建于1982 年，目前拥有专业技术人员557人，高级职称60人，中级职称152人，研究生78人，博士生8人。科室齐全，设心病科、脑病科、康复科、内分泌科、脾胃病科、肺病科、外科、妇科、肛肠科、骨伤科等二十余个科室，拥有国家级重点专科3个，为脑病科、肺病科、心病科。针灸推拿科为北京特色专科，区级重点专科3个。
第四名北京市第一中西医结合医院内分泌科
北京市第一中西医结合医院，是一所由朝阳区政府主办的三级甲等中西医结合医院，集医疗、科研、教学、预防保健和急救为一体的公立医疗机构，设有心血管内科、内分泌科、骨伤科、脑病科、呼吸内科、外科、肾内科、眼科、儿科、妇产科等21个临床科室，11个病区，药剂科、检验科、放射科、病理科等9个医技科室，在原朝阳区体检中心基础上，积极发展中医预防保健工作，打造中西医结合特色突出的治未病科。
第五名中国中医科学院广安门医院内分泌科
中国中医科学院广安门医院(暨中国中医科学院第二临床医药研究所)始建于1955年，是国家中医药管理局直属的集医疗、教学、科研和预防保健为一体的三级甲等中医医院，是中央干部保健基地，全国“示范中医医院”，2008北京奥运会和残奥会定点医院，北京市医疗保险A类定点医院，首都文明单位标兵，中央国家机关文明单位标兵，首都卫生系统文明单位标兵，中央国家机关平安先进单位，ISO9001质量管理认证单位，还是世界卫生组织传统医学合作中心组成单位，国家食品药品监督管理局国家药物临床实验机构，卫生部西医学习中医教学 [收起]