推拿科前身为正骨科，创建于1970年。1992年罗志瑜主任医师任中医推拿科科主任，曾荣获上海市卫生系统第二届高尚医德奖。2003年至今章家福主任医师任主任，章家福主任曾被《中华中医药学会》评为首届全国“中医药康复保健优秀人才”。随着医院的发展，中医推拿科科室目前形成以虹口本部和松江南部协同发展的格局。科室现有5名医生。其中主任医师1名，副主任医师3名，住院医师1名。
推拿科是“全国示范中医科”的组成部分之一，是上海市针灸推拿医学中心网络单位，已成为上海市住院医师培训基地。完成国家自然科学基金一项。在研上海市科委课题一项，上海市针灸推拿医学重点课题一项，上海市卫生局中医药科研基金二项。参编《中国医学百科全书──推拿学》、《中医推拿学》（全国高等医学院校教学参考丛书）、《当代中国骨科临床与康复》等著作。
推拿科学科发展的策略问题上，倡导应用现代医学知识，中西医结合，发展中医推拿学科。提出以中医络理论结合解剖、生理、病理知识发展中医推拿学科的观点。确定了推拿手法生物力学研究方向。完成了国家自然科学基金项目“推拿手法深透性与生物组织作用机制研究”对于科学地提高手法效率、并为今后手法仿真学、手法工效学等研究打下了良好的基础。以颈性眩晕、脊髓型颈椎病、颈椎间盘突出症、腰椎间盘突出症、慢性疲劳综合征及小儿腹泻为主攻方向，建立完善以临床为基础、以科技为先导的现代推拿临床医学模式，大力推进特色诊疗技术的自主创新，积极应用现代科学技术发展传统推拿技术。颈性眩晕即时止眩技术、根性痛即时止痛技术、神经损伤功能恢复手段、脊柱推拿短杠杆微调手法、推拿手法治疗与脊柱功能性锻炼结合及小儿腹泻推拿治疗技术，手法、功法的目的性明确，针对性强，使推拿治疗效果显著上升。中医推拿科诊治的疾病谱中，依据循证医学，大量临床量表的应用使诊疗规范化程度有了显著提高。
推拿科临床以脊柱推拿为重点，脊柱推拿手法技术和理论居国内先进。在传统手法应用的基础上，吸纳包括脊柱微调手法、龙氏手法、美式整脊手法以及澳洲手法等众多国内外手法，针对不同病种的特点和手法作用的生物力学特性，形成一套有针对性的诊疗体系，极大的提高了临床患者的疗效和安全性，减少患者的痛苦和病程。重点病种为：神经根型颈椎病、颈性眩晕、脊髓型颈椎病、颈椎间盘突出症、腰椎间盘突出症、腰椎滑脱症、骶髂关节炎及其他脊柱相关性疾病。
推拿科现开设颈椎病专科门诊、腰椎间盘突出症专科门诊等。现有设备包括：牵引床、TN-2型推拿治疗床、美式整脊床等专科医疗器械。
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