儿童泌尿外科是八一儿童医院重点建设专科，是集医疗、教学、科研于一体的全军第一家儿童泌尿外科专科。
儿童泌尿外科配备有小儿膀胱镜、输尿管镜、小儿腹腔镜、膀胱软镜、肾盂软镜、尿流率测定仪等国内先进的小儿泌尿专科器械，具有成功开展各类小儿泌尿外科手术的最好硬件设施。其学科带头人是专业从事小儿泌尿专科的周辉霞主任，在她的带领下，儿童泌尿外科精干而充满朝气的专科团队年完成小儿泌尿系先天性畸形及肿瘤和创伤的外科手术近千台次，并对小儿泌尿外科腹腔镜、输尿管镜、膀胱镜等腔内微创手术技术有深入研究并取得良好临床应用成效，能完成13类小儿泌尿外科腹腔镜手术，手术范围涵盖小儿泌尿及男生殖系统所有体腔内器官，是我国目前唯一一家能系列开展腹腔镜手术的儿童泌尿专科，其微创技术已达到了国内和军内领先水平。
北京军区总医院历史悠久，附属八一儿童医院小儿外科现有专家2人，顾问1人，高年资医师2人，拥有以博士后、博士、硕士为主的优秀专科人才，同时配备了专门的监护病房医疗团队。硬件方面，儿童外科普通病房及监护室病房共90张床位，国内一流的NICU、PICU病房、进口新生儿专用呼吸机、心电监护仪等先进医疗设备，增强了外科围手术期的支持治疗。腹腔镜、胸腔镜、膀胱镜等设备为我们开展微创外科手术提供了良好的条件。 儿童外科主要治疗新生儿外科、儿童普通外科、肿瘤外科、小儿泌外等专业的常见病、多发病，以及疑难杂症，具有一支经验丰富，医疗技术精湛，服务热情周到技术队伍。并与北京多家儿童医院外科有着密切的学术交流，在疾病的诊治方面达到强强联合，使患儿得到最大的受益。最优的治疗和最好的服务是儿童外科人努力的目标。
小儿外科开展范围
新生儿外科：主要治疗新生儿食道闭锁，胃食管反流，胃壁缺损、幽门梗阻、十二指肠梗阻、肠旋转不良、肠闭锁、肠重复畸形、美克尔憩室、先天性巨结肠、各种肛门直肠畸形（肛门闭锁、肛门狭窄、直肠尿道瘘、直肠阴道瘘）、新生儿膈疝，腹壁裂，脐膨出，消化道穿孔（胃破裂、肠穿孔等），胆道闭锁等。
小儿普通外科：主要治疗斜颈，甲状舌管囊肿，小儿急腹症（包括阑尾炎、腹膜炎、消化道出血、嵌顿疝、消化道穿孔以及腹部外伤等），腹股沟疝，巨结肠，肠重复畸形，先天性胆总管囊肿，门静脉高压症，各种腹部良恶性肿瘤（肝脏肿瘤，胰腺肿瘤，腹膜后恶性肿瘤，畸胎瘤等），体表肿瘤（血管瘤、淋巴管瘤、脂肪瘤、神经纤维瘤以及各种小肿物）。
小儿微创外科：利用胸腔镜、腹腔镜及膀胱镜开展多种微创手术，例如：腔镜下贲门胃底折叠术、膈肌修补术、美克尔憩室切除术、幽门环肌切开术、阑尾切除术、疝囊高位结扎术、胆道探查术、胆总管囊囊肿切除术、腹腔探查术、睾丸下降固定术、精索静脉高位结扎术；肺大泡切除术、漏斗胸矫形NUSS手术；膀胱镜检查异物取出及活检术等。
特色手术：小儿肝脏移植手术。
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