福建治疗慢性结肠炎比较好的三甲医院有1、福州市传染病医院，2、厦门大学附属第一医院，3、莆田学院附属医院等，慢性结肠炎属于传染科，福州市传染病医院传染科疾病医疗设施齐全，在传染科疾病治疗方面有着丰富的经验；厦门大学附属第一医院传染科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名福州市传染病医院传染科
福建医科大学孟超肝胆医院是一所集医疗、教学、科研和新技术研发于一体的大专科小综合三级甲等专科研究型医院，医院承担全省各种肝病、肝癌及感染病的诊治、培训、会诊和教学任务，拥有肝胆外科及肝移植、肝病及消化内科、中西医结合肝病、感染病、肝病介入、重症医学及血液净化、影像及检验等特色专业，多学科、多专业优势互补，形成完善的肝病、肝癌及感染病临床综合诊疗技术平台，是省内具备综合救治疑难危重肝病和肝癌能力的医疗单位。
第二名厦门大学附属第一医院传染科
医院有内、外、妇、儿、急诊、护理等25个临床教研室，现有临床教师1034人，博士生导师、硕士生导师107人，在院规培生及进修实习医学生1800余人（全市第1，全省第4）。现有20个国家级住院医师规范化培训基地，基地数量在闽西南地区最多最全。
第三名莆田学院附属医院传染科
莆田学院附属医院是福建省最早的医院之一，医院（新旧两区）占地总面积近300亩，总建筑面积24万多平方米，开放床位2200张。现有教职员工2500余人，其中享受国务院政府特殊津贴专家4人，高级职称410余人，省人事厅批准的教授、副教授47人，博士生导师和硕士生导师16人，博士后、博士及硕士320余人。设有68个临床医技科室，40个病区，52种专业。目前有1个院士工作站、17个市医学分会及8个质控中心挂靠我院。 [收起]