福建治疗牛痘比较好的三级医院有1、厦门市第三医院，2、泉州儿童医院，3、三明市第二医院，4、安溪县医院等，牛痘属于传染科，厦门市第三医院传染科疾病医疗设施齐全，在传染科疾病治疗方面有着丰富的经验；泉州儿童医院传染科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名厦门市第三医院传染科
福建中医药大学附属厦门第三医院始创于1920年，是岛外一所历史悠久集医疗、教学、科研、预防保健为一体的大型三级乙等综合性医院、国家级爱婴医院、福建省道路交通事故伤员救治定点医院、国际紧急救援网络医院、“省级文明医院”、福建医科大学临床教学医院、福建省临床住院医师规范化培训基地。医院编制床位1000张，占地面积140亩，建筑面积9.3万平方米，内设13个党政后勤管理机构，38个业务科室，职工1460人，其中高级职称124人，中级职称282人。
第二名泉州儿童医院传染科
泉州市儿童医院创建于1990年元月,前身是福建一所侨建公办的儿童医院,。设NICU、PICU、新生儿、小儿外科、感染科、神经康复、肾脏血液、哮喘、小儿心血管中心、眼科、妇科、产科和VIP等十八个专业病区和相应的专科门诊。是“福建省新生儿疾病筛查中心泉州分中心”和“福建省新生儿救护中心泉州分中心”的所在医院。
第三名三明市第二医院传染科
三明市第二医院地处风景秀丽的中国优秀旅游城市、中国魅力城市永安。成立于1937年，前身是福建省立医院，至今已有70余年的历史。是一所融医疗、教学、科研、预防为一体的地市级综合性医院。2000年通过卫生部“三级乙等”医院评审，担负着三明地区及周边280多万人员的医疗救治任务。为三明市职工社会医疗保险、铁路职工社会医疗保险、三明市新型农村合作医疗定点医院。
第四名安溪县医院传染科
安溪县医院始建于1938年。1996年7月，安溪县医院与创建于1993年的安溪县铭选医院合并。合并后的安溪县医院位于凤城镇河滨南路的龙湖开发区，第一名称为安溪县医院，第二名称为安溪县(铭选)医院，被福建医科大学、泉州医高专、莆田学院及安溪卫校确定为教学医院。是一所集医疗、急救、科研、教学、预防、保健、康复为一体的综合性二级甲等医院、国际爱婴医院、突发公共卫生事件医疗救治定点医院.几年来，医院坚持以病人为中心，以社会效益为准则，以质量为根本，把最好的医疗技术、最优质的医疗服务、最佳的专业品牌竭诚奉献给茶乡人民。 [收起]