北京治疗直肠膨出比较好的三甲医院有1、北京中西医结合医院，2、中国中医科学院望京医院，3、北京二龙路医院，4、北京中医药大学东直门医院，5、北京中医药大学东直门医院东区等，直肠膨出属于肛肠科，北京中西医结合医院肛肠科疾病医疗设施齐全，在肛肠科疾病治疗方面有着丰富的经验；中国中医科学院望京医院肛肠科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京中西医结合医院肛肠科
北京市中西医结合医院始建于1952年，地处长安街沿线，西四环外200米，位于北京市海淀区永定路东街3号，原名北京市第二疗养院;1956年迁至现址，1959年7月改名为北京市永定路医院;1989年纳入全国第一批中西医结合医院，获批更名为北京市中西医结合医院;1994年，遵循国家中医药发展战略，医院与北京中医药大学实现合作，成为北京中医药大学附属中西医结合医院;1996年医院挂牌全国专科疾病北京中医药治疗中心;2011年启动了博士后工作流动站工作;2016年医院成为国家中医药管理局第三批重点中西医结合医院;2016年11月，通过三级中西医结合医院等级评审，实现了医院跨越式发展。
第二名中国中医科学院望京医院肛肠科
中国中医科学院望京医院是一所以中医骨伤临床为重点，其他学科同步发展，满足区域医疗及公共卫生需求为主体，以中医骨伤科临床研究基地和中医康复中心建设为方向，中西医并重，内外兼治，急诊及应急服务能力突出，传统与现代诊疗技术相结合的三级甲等中医医院，是国家中医药管理局的直属医院，现包括两个部分：医院本部和骨伤医疗中心。医院本部位于朝阳区花家地街，骨伤医疗中心位于东直门内南小街甲16号。医院荣获 “全国文明单位”、“首都文明单位”、“中央国家机关文明单位”、“首都卫生系统文明单位”等称号。
第三名北京二龙路医院肛肠科
北京市肛肠医院(北京市二龙路医院)创立于1937年，是一所以治疗肛肠疾病为特色，融医疗、教学、科研、预防为一体的医保定点二级甲等医院。2012年成立了“北京市肛肠疾病研究院”。医院设有肛肠外科、内科、外科、妇科、中医科、口腔科、眼科、五官科、骨科、针灸科、皮科等27个临床科室11个医技科室，下设德胜社区卫生服务中心及七个社区卫生服务站。2012年7月在西城区德外大街16号高科技园区内北院区投入使用，床位总量达到400张，医院建筑总面积3.9万平方米。
第四名北京中医药大学东直门医院肛肠科
东直门医院是一所集医疗、教学、科研于一体的大型综合性三级甲等中医医院，是国家中医临床研究基地，是国家食品药品监督管理局认定的国家药物临床试验机构，是世界卫生组织中医适宜技术项目培训基地，是国家住院医师规范化培训示范基地，是首批全国示范中医院、北京市医疗保险定点医院，是国家级中医学实验教学示范中心，是教育部大学生校外实践教育基地。
第五名北京中医药大学东直门医院东区肛肠科
北京中医药大学东直门医院东区(原北京市通州区中医医院)坐落于北京的东大门, 始建于1982 年，目前拥有专业技术人员557人，高级职称60人，中级职称152人，研究生78人，博士生8人。科室齐全，设心病科、脑病科、康复科、内分泌科、脾胃病科、肺病科、外科、妇科、肛肠科、骨伤科等二十余个科室，拥有国家级重点专科3个，为脑病科、肺病科、心病科。针灸推拿科为北京特色专科，区级重点专科3个。 [收起]