山东治疗新生儿心肌炎比较好的三甲医院有1、山东省妇幼保健院，2、济南市章丘区中医医院，3、济南市妇幼保健院，4、青岛市中西医结合医院-附院，5、青岛大学附属医院东部院区等，新生儿心肌炎属于儿科，山东省妇幼保健院儿科疾病医疗设施齐全，在儿科疾病治疗方面有着丰富的经验；济南市章丘区中医医院儿科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名山东省妇幼保健院儿科
山东省妇幼保健院（山东省妇产医院）始建于1989年，直属于省卫生健康委。2004年5月加入山东省立医院集团，2016年11月与原山东省计划生育科学技术研究所整合，2018年6月山东省生物制品研究所整建制并入，是一所具有公共卫生性质的集妇幼保健、医疗、科研、教学、预防、康复和妇幼保健技术指导为一体的省级妇幼保健机构。承担全省妇女儿童健康状况及影响因素信息的收集、汇总、分析工作，开展全省妇幼保健、优生优育、不孕不育、生殖健康等领域的科学技术研究并组织推广，面向社会开展疾病诊治、保健、预防、计划生育技术、生殖健康、产前筛查及诊断、新生儿疾病筛查等服务，为基层医疗保健机构提供业务指导和技术支持。
第二名济南市章丘区中医医院儿科
章丘市中医医院始建于1984年，是一所集医疗、保健、科研、教学、文化五位一体的国家三级甲等中医医院，是“济南市第二中医医院”“山东省医科院附属医院”“山东中医药大学教学医院”“北京中医医院协作医院”“山东省千佛山医院合作医院”。医院职工800余人（含合同制员工），占地面积50余亩，门诊病房综合楼启用后，业务用房面积达到7.5万平方米，设置床位1000张，实际开放床位600张，固定资产总额超过2亿元。医院先后荣获“全国中医药文化建设试点单位”“全国中医特色护理优秀科室”“山东省卫生工作先进集体”“山东省中医工作先进单位”等荣誉称号。
第三名济南市妇幼保健院儿科
济南市妇幼保健院（山东第一医科大学附属济南妇幼保健院）创建于1951年，经过近70年的建设发展，现已成为一所集医疗、保健、预防、康复、科研、教学为一体的三级甲等妇幼保健院。医院年门诊量120余万人次，年出院3.2万人次，年手术量2万余台，年分娩新生儿近2万名，分娩量约占市区的1/3。医院业务水平和业务量在全省16地市妇幼保健院中始终位居龙头地位，综合排名在全国15所副省级三甲妇幼保健院中位列第五，人均门诊量、人均住院量和工作效率在全国副省级三甲妇幼保健院中都排名第一。
第四名青岛市中西医结合医院-附院儿科
　　山东青岛中西医结合医院是山东省首家中西医结合医院。1989年确立为山东中医药大学教学医院，院内设有青岛市中西医结合研究所。1995年经国家、省中医管理局批准为三级甲等中西医结合医院。2006年确立为山东中医药大学临床教学科研基地,2007年确立为第二批国家中医药管理重点中西医结合医院建设单位。2012年通过三甲等中西医结合医院复审。医院具有百年历史，始建于1906年，位于繁华的市南区，毗邻青岛...
第五名青岛大学附属医院东部院区儿科
　　2006年12月，青医附院全资收购位于崂山区海尔路59号的原青岛万杰医院，建立了青医附院东区。2007年1月青医附院东区正式开业，从开业之日起东区就以构建"小综合、大专科"为方向，以心血管病诊疗、微创外科治疗、肿瘤诊疗、妇儿生殖医学、急救医学等为重点和特色，下设27个临床科室和8个医技科室。同时，一大批蜚声省内外的资深专家为前来东区就医的患者提供高水平的诊疗服务。青医附院东区的建立和发展，有效... [收起]