北京治疗菌血症比较好的三甲医院有1、亦庄同仁医院，2、北京复兴医院干部保健科 ，3、首都医科大学附属北京友谊医院，4、北京大学肿瘤医院，5、北京积水潭医院等，菌血症属于血液科，亦庄同仁医院血液科疾病医疗设施齐全，在血液科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京复兴医院干部保健科 血液科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名亦庄同仁医院血液科
亦庄同仁医院（即同仁医院南区）是北京同仁医院的三大直属院区之一，北京市A类医保定点医院(医保就诊不受医院限制)。三种特殊病种（肾移植后服用抗排异药、血液透析以及恶性肿瘤门诊放化疗）医保医院。亦庄同仁医院于2004年5月开业，是亦庄地区规模最大、科室设置最齐全、设备最先进的医院，也是北京东南区域唯一的三级甲等医院，可满足社会医疗保险及其他各种医疗需求。亦庄同仁医院一期占地5万平方米，有4层门诊楼和9...
第二名北京复兴医院干部保健科 血液科
　　首都医科大学附属复兴医院建于1950年，经过60多年的发展，现已成为集医疗、教学、科研、预防和社区卫生服务为一体的、拥有妇科内镜、心血管防治、危重症医学（ICU）、月坛社区服务等特色学科的三级综合医院。 　　医院建筑面积102133.71平方米，设有临床科室34个、医技科室9个，编制床位816张，开放床位798张。 　　全院有卫生技术人员1301人，其中高级技术人员184人，包括博士生导师3人...
第三名首都医科大学附属北京友谊医院血液科
首都医科大学附属北京友谊医院原名为北京苏联红十字医院，始建于1952年。医院设有北京市临床医学研究所、北京热带医学研究所、北京市中西医结合研究所和北京市卫生局泌尿外科研究所，拥有一批学科带头人和技术骨干。胃肠肝胆胰疾病诊治、泌尿系统疾病诊治和肾移植、热带病和寄生虫病诊治以及中西医结合是医院的四大专业特色。内科学(消化系病)是国家重点(培育)学科;消化内科、临床护理、地方病(热带医学)、普通外科、重症医学科、老年病科、检验科、病理科获批国家临床重点专科。
第四名北京大学肿瘤医院血液科
北京大学肿瘤医院设有34个临床科室，14个医技科室，17个基础研究科室,开放床位776张。全年门诊量66万人次，年收治病人7.8万人次，手术近1.6万例。医院职工近2400人，在编职工中正高级职称124人，副高级职称211人。 北京大学肿瘤医院有国家重点学科1个(肿瘤学)、国家临床重点专科2个(肿瘤科、病理科)、北京市重点学科4个(北京市胃癌防治中心、北京市乳腺癌防治中心、北京市影像介入治疗中心、超声诊断中心)、北京市中医管理局重点学科1个(中西医结合科暨老年肿瘤科)，全国名老中医药专家传承工作室1个，北京学者工作室1个，是恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室、恶性肿瘤转化研究北京市重点实验室。
第五名北京积水潭医院血液科
北京积水潭医院是一家王府花园式医院。以骨科和烧伤科为重点学科，内、外、妇、 眼、口腔、耳鼻喉、皮肤性病、中医内科、中医正骨、针灸、理疗康复科等并驾齐驱的三级甲等综合性医院(北京积水潭医院是北京市直属差额拨款事业单位，事业编制2900人。医院设有职能处室16个，其中内设管理部门5个，设有临床及医技科室53个，现实有在岗人员2519人，有院级领导9人，职能部门中层领导30人)。 [收起]