全国治疗肾盂肾炎比较好的三甲医院有1、上海交通大学医学院附属瑞金医院，2、北京中西医结合医院，3、北京积水潭医院，4、中国康复研究中心（北京博爱医院），5、上海中医药大学附属龙华医院等，肾盂肾炎属于肾病科，上海交通大学医学院附属瑞金医院肾病科疾病医疗设施齐全，在肾病科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京中西医结合医院肾病科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名上海交通大学医学院附属瑞金医院肾病科
上海瑞金医院建于1907年,原名广慈医院,是一所三级甲等大型综合性教学医院。医院设有34个临床科室、9个医技科室;现有国家教育部重点学科3个(内分泌、血液、消化),上海市重中之重学科1个(血液),上海市重点学科1个(内分泌),上海市优势学科一个(肾脏),上海市教委重点学科6个(消化外科、血液科、内分泌科、骨科、烧伤科、心脏内科),上海市卫生局医学领先专业重点学科3个(消化外科、血液科、肾脏内科)。
第二名北京中西医结合医院肾病科
北京市中西医结合医院始建于1952年，地处长安街沿线，西四环外200米，位于北京市海淀区永定路东街3号，原名北京市第二疗养院;1956年迁至现址，1959年7月改名为北京市永定路医院;1989年纳入全国第一批中西医结合医院，获批更名为北京市中西医结合医院;1994年，遵循国家中医药发展战略，医院与北京中医药大学实现合作，成为北京中医药大学附属中西医结合医院;1996年医院挂牌全国专科疾病北京中医药治疗中心;2011年启动了博士后工作流动站工作;2016年医院成为国家中医药管理局第三批重点中西医结合医院;2016年11月，通过三级中西医结合医院等级评审，实现了医院跨越式发展。
第三名北京积水潭医院肾病科
北京积水潭医院是一家王府花园式医院。以骨科和烧伤科为重点学科，内、外、妇、 眼、口腔、耳鼻喉、皮肤性病、中医内科、中医正骨、针灸、理疗康复科等并驾齐驱的三级甲等综合性医院(北京积水潭医院是北京市直属差额拨款事业单位，事业编制2900人。医院设有职能处室16个，其中内设管理部门5个，设有临床及医技科室53个，现实有在岗人员2519人，有院级领导9人，职能部门中层领导30人)。
第四名中国康复研究中心（北京博爱医院）肾病科
中国康复研究中心是集康复医疗、康复科学技术研究、康复人才培养、康复信息服务、康复工程研究以及社会服务指导于一体的综合性康复机构和技术资源中心。她由职能处室、业务科室、康复信息研究所、康复工程研究所、康复医学研究所、康复医学院、社会服务指导中心等部门组成。“中心”占地面积近300亩，建筑面积15万平方米，员工1373多人。主要以脊柱脊髓损伤、脑卒中、脑外伤、神经系统、截肢、骨关节伤病、小儿麻痹后遗症、小儿脑瘫等病症引起的功能障碍为康复治疗的对象。同时还对老年病、白内障、心血管系统、呼吸系统、泌尿系统等疾病开展系统的康复和治疗。
第五名上海中医药大学附属龙华医院肾病科
龙华医院创建于1960年7月,是全国最早建立的四大中医临床基地之一。近50年来,医院坚持中医为主的办院方向,走名医、名科、名院之路。规模不断扩大,中医药学术地位不断提升,已成为集医疗、教学、科研为一体,中医特色鲜明和中医优势突出的全国示范中医院、上海市三级甲等医院、上海市精神文明单位10连冠。2008年12月医院被国家中医药管理局确认为国家中医临床研究基地建设单位,承担恶性肿瘤和骨退行性病变的研究。龙华医院总院占地面积52.3亩,位于上海城区西南面,建筑总面积87101.1平方米。编制床位703 [收起]