全国治疗儿童肥胖症比较好的三甲医院有1、首都儿科研究所附属儿童医院，2、北京中医药大学附属护国寺中医医院，3、上海市儿童医院，4、北京大学深圳医院，5、湖南省生殖医学研究院等，儿童肥胖症属于中医科，首都儿科研究所附属儿童医院中医科疾病医疗设施齐全，在中医科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京中医药大学附属护国寺中医医院中医科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名首都儿科研究所附属儿童医院中医科
首都儿科研究所是一所以医学基础研究、儿科疾病发病机理研究、儿童保健为重点，承担有医疗、教学和预防任务的应用医学研究机构。其前身是中国医学科学院儿科研究所 ,成立于1958年，是新中国第一家儿科医学研究所。于1983年隶属北京市，1984年开设门诊，1986年建立附属儿童医院。1993年，在京郊顺义区组建“北京市医用生物制品中试基地”。研究所先后10次获得北京市属科研院所“改革与发展”一等奖，18次获得首都及卫生系统“文明单位”的称号。50多年来，经过几代人的不懈奋斗，研究所已发展成为集儿科基础医学、临床医学、高等医学教育、预防保健医学为一体的全国知名的医学研究机构。
第二名北京中医药大学附属护国寺中医医院中医科
护国寺中医医院是北京市最早的公立中医医疗机构。早在六十年代，就作为北京中医学院(现北京中医药大学)的教学、实习医院，医院开设有内、外、针灸、肿瘤、骨科8个病区;门诊设有内、外、针、骨、妇、儿、皮、眼、五官、口腔、急诊及放射、CT、检验、心电、超声、心脑功能捡查、手术室、中西药房、中西药制剂等科室20余个;有普通门诊、专家门诊为患者提供优质服务，全国著名中医内科专家许彭龄教授等众多专家定期应诊。
第三名上海市儿童医院中医科
上海市儿童医院是一所集医疗、保健、教学、科研、康复于一体的三级甲等儿童医院，前身是上海难童医院，1953年更名为上海市儿童医院，医院设有儿科类全部专业，优势特色专科有重症医学科、新生儿科、肾脏科、呼吸科、血液科、消化科、心脏内科、神经内科、内分泌科、临床免疫科、普外科、胸心外科、神经外科、骨科、泌尿外科、耳鼻咽喉头颈外科、儿童保健科、皮肤科、眼科、中医科、口腔科、康复科等。
第四名北京大学深圳医院中医科
北京大学深圳医院原名深圳市中心医院，是深圳市政府投资建成的现代化综合性医院。开设52个临床医技科室，其中1个国家级合作重点学科、8个省级临床重点医学专科、1个省级重点实验室、8个市级重点学科及实验室。医院开展的一大批医学高新技术和特色服务项目，吸引了深圳、香港、澳门以及周边地区的大批患者，还有来自全球36个国家和地区的外宾前来就诊。
第五名湖南省生殖医学研究院中医科
湖南省妇幼保健院成立于1947年，是湖南省卫生健康委直属的集医疗、妇幼保健、临床教学、科研于一体的三级甲等妇幼保健院，是国家博士后工作站、国家住院医师培训专业基地、国家药物临床实验基地（GCP）、国家级爱婴医院、国家级母婴友好医院。医院担负着全省妇女儿童的保健、医疗、健康教育、科研教学、妇幼保健基层技术指导、妇幼卫生人员培训、妇幼卫生信息管理等多项任务,对全省14个市州、122个县的妇幼保健机构进行业务管理和技术指导，是湖南省妇幼保健技术指导的龙头单位。 [收起]