全国治疗溃疡性结肠炎比较好的三甲医院有1、复旦大学附属中山医院，2、中国中医科学院西苑医院，3、北京大学肿瘤医院，4、首都儿科研究所附属儿童医院，5、首都医科大学附属北京儿童医院等，溃疡性结肠炎属于中医科，复旦大学附属中山医院中医科疾病医疗设施齐全，在中医科疾病治疗方面有着丰富的经验；中国中医科学院西苑医院中医科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名复旦大学附属中山医院中医科
复旦大学附属中山医院是国家卫生和计划生育委员会预算管理单位，是复旦大学的附属综合性教学医院。医院开业于1937年，是当时中国人管理的第一所大型综合性医院，隶属于国立上海医学院，医院设有除儿科以外的所有科室、综合实力雄厚。心脏、肝癌、肾脏和肺部疾病诊治是医院的重点和特色，诊治水平始终处于国内领先地位。国家临床重点专科18个：消化科、检验科、麻醉科、心血管内科、内分泌科、胸外科、心脏大血管外科、临床护理、中医脑病科、呼吸内科、肾病科、普通外科、重症医学科、肿瘤科、医学影像科、器官移植科、急诊医学科和神经内科。心血管病和肝肿瘤为上海市临床医学中心。
第二名中国中医科学院西苑医院中医科
中国中医科学院西苑医院（简称“西苑医院”）创建于1955年12月，是新中国成立后由中央人民政府建设的第一所大型中医医院。经过60多年的发展，现已成为一所中医特色突出，诊疗优势明显，在国内国际具有较大影响力，集医疗、科研、教学、保健为一体的三级甲等综合性中医医院。
第三名北京大学肿瘤医院中医科
北京大学肿瘤医院设有34个临床科室，14个医技科室，17个基础研究科室,开放床位776张。全年门诊量66万人次，年收治病人7.8万人次，手术近1.6万例。医院职工近2400人，在编职工中正高级职称124人，副高级职称211人。 北京大学肿瘤医院有国家重点学科1个(肿瘤学)、国家临床重点专科2个(肿瘤科、病理科)、北京市重点学科4个(北京市胃癌防治中心、北京市乳腺癌防治中心、北京市影像介入治疗中心、超声诊断中心)、北京市中医管理局重点学科1个(中西医结合科暨老年肿瘤科)，全国名老中医药专家传承工作室1个，北京学者工作室1个，是恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室、恶性肿瘤转化研究北京市重点实验室。
第四名首都儿科研究所附属儿童医院中医科
首都儿科研究所是一所以医学基础研究、儿科疾病发病机理研究、儿童保健为重点，承担有医疗、教学和预防任务的应用医学研究机构。其前身是中国医学科学院儿科研究所 ,成立于1958年，是新中国第一家儿科医学研究所。于1983年隶属北京市，1984年开设门诊，1986年建立附属儿童医院。1993年，在京郊顺义区组建“北京市医用生物制品中试基地”。研究所先后10次获得北京市属科研院所“改革与发展”一等奖，18次获得首都及卫生系统“文明单位”的称号。50多年来，经过几代人的不懈奋斗，研究所已发展成为集儿科基础医学、临床医学、高等医学教育、预防保健医学为一体的全国知名的医学研究机构。
第五名首都医科大学附属北京儿童医院中医科
首都医科大学附属北京儿童医院是集医疗、科研、教学、保健于一体的三级甲等综合性儿科医院，前身是我国现代儿科医学奠基人诸福棠院士于1942年创办的北平私立儿童医院。医院总占地面积7万平方米，建筑面积12万平方米，编制病床970张，年门诊量300余万人次，住院病人7万余人次，手术逾2.3万例。2017年，医院被国家卫生健康委(原国家卫生计生委)批准成为国家儿童医学中心，2019年被批准设立国家儿童肿瘤监测中心，为儿童血液病、恶性肿瘤防控提供大数据支撑。 [收起]