传染科成立于上世纪八十年代，经过老一代专家近三十余年的努力，该科始终站在菏泽市的前沿，已发展为具有一定影响力和竞争力的科室，2003年非典暴发流行后，为适应传染病的控制、隔离和治疗，我院征地30亩建成一所100张床位具有现代化设施集临床、教学、科研为一体的传染病科。当突发传染病疫情时，可扩展至200张病床。现有正主任医师2人，副主任医师3人，主治医师2人及住院医师5人，护理15人。传染科多年来肩负着本区域的传染病预防及救治工作，使本县历年来的传染病流行都能得到很好地控制，对各种传染病的治疗积累了丰富的经验，对流脑、乙脑、麻疹、伤寒、脊髓灰质炎、霍乱、菌痢、性病、艾滋病有良好的治疗方法。
传染科的快速发展有赖于医院领导大力支持及先进的实验设备作为平台，实验室拥有大量国际一流的检测设备，全自动生化分析仪、自动酶免分析仪、荧光定量PCR分析仪、全自动荧光定量 PCR分析仪、全自动血细胞分析仪。能够开展检测项目200余项，如肝功能组合项目检测、乙肝病毒五项指标定性检测、丙肝、戊肝病毒血清学定性检测及血清乙肝病毒 （HBV-DNA）定量检测及变异检测。为病毒性肝炎的治疗提供了科学的依据和有力的保障。相继完成了“脐血淋巴细胞提取液治疗慢性乙肝”、“树突状细胞治疗慢性乙肝”、“中西医结合治疗肝炎肝硬化的临床研究”、“规范化抗病毒治疗慢性乙型肝炎的临床研究”、抗病毒药物单独或联合或续惯治疗慢性病毒性肝炎、“重型肝炎抢救”、“腹水超浓缩回输治疗顽固性腹水的临床研究”、“阿德福韦酯治疗慢性乙肝野生株与变异株的对比研究”、“阿德福韦酯治疗失代偿性肝硬化的临床研究”等多项科研”，并获得菏泽市科技进步奖。人工肝支持治疗系统治疗重症肝炎。无创肝纤维化检测仪判断肝炎病人肝纤维化程度可与肝穿刺病理检查相媲美，可获得较好的经济及社会效益。
传染病科与与北京地坛医院、佑安医院、302医院等国家级传染病院、山东省立医院肝病中心、济南市传染病院、齐鲁医院肝病科等省级传染病院及肝病科等国内顶尖的院校保持密切联系，是山东大学齐鲁医院的合作医院。承担济宁医学院、滨州医学院、潍坊医学院、泰安医学院、菏泽医专等学校的教学任务。除担负传染病的治疗之外，更主要的是对传染病的隔离，对控制传染病流行起到重要的作用，另外我科还担负着传染病预防知识的宣传工作，定时举行传染病知识讲座，并参与卫生部开展县级慢性乙肝诊治培训活动。对单县传染病知识的普及作出积极的贡献。传染科常年开设传染病及肝炎门诊，为病人提供一流的技术、一流的质量、一流的服务，由于全体工作人员的共同努力，已得到广大肝炎病人的认可，吸引了周围四省八县的广大慢性乙肝及传染病患者患者前来就诊。
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