肝胆外科成立于1980年，是80年代全国仅有的几个肝胆外科中心之一，现为兰州军区中心科室和重点学科，第四军医大学及北京军医学院教学基地。医师系列具有硕士以上学历者占90%。近年来在统计源期刊发表学术论文200余篇，参加编写专著6部，获科技成果奖29项，在西北地区领先开展新技术70余项，学科带头人为国内及省内普外肝胆学会主要负责人。主治医师以上人员均多次在北京、上海、重庆等国内最权威的肝胆外科医院（科室）工作、学习过，建立了横向联系协作网，构成了科室保持专科水平的关键软件基础。此外，科室拥有电视腹腔镜、纤维胆道镜、纤维十二指肠镜、多极射频治疗仪、微波刀等多种大型专科医疗设备，总价值近400万元，为保持专科技术水平提供了重要的硬件保障。经过二十余年的努力，目前科室的胆道外科具备国内先进水平。肝，胰外科为西北地区领先水平。
自成立以来，潜心钻研肝内胆管结石、肌囊结石、先天性胆管囊肿、肝癌、胆囊癌、胆管癌、胰腺癌、肝囊肿、肝血管瘤、门脉高压症及重症胰腺炎等专科疾病，积累了丰富的诊治经验，为兄弟医院会诊手术疑难病例累计超过500例次。擅长手术处理风险度甚高的肝胆外科疾病是该科的一大特色。在常见病方面，累计完成胆囊切除手术数万例，1994年以来开展的腹腔镜胆囊切除及小切口胆囊切除也发展成为新的亮点。
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