放疗科始建于1983年，是新疆最早开展放射治疗的单位之一。科室由放疗门诊、放疗机房、放疗病房三部分组成。共有医护人员33人，其中医师14人，护士19人，正高级职称者2人，副高级职称者3人，中级职称者6人；硕士研究生5人，在读硕士研究生2人。2002年引进了当时国内最先进的医科达MLC直线加速器及三维治疗计划系统(诺力刀)，中子后装机(中子刀)，并引进了飞利浦大孔径放疗专用CT机，使我院放疗设备一跃跨入国内一流水平。2003年11月成立了放疗病房，时有病床25张，现有床位50张。近5年来，有4人6次先后被派往中国医科院肿瘤医院放疗科，哈尔滨医科大学肿瘤医院放疗科，山东省肿瘤医院放疗科进修学习，培养了人才，也使我院放疗技术达到了国内先进水平。与中国医科院肿瘤医院、哈尔滨医科大学肿瘤医院、天津医科大学肿瘤医院建立了较密切的业务关系。医院特聘全国著名放射肿瘤治疗专家殷尉伯教授、余子豪教授、徐国镇教授为我院肿瘤放射治疗学术及临床事务指导委员会委员，不定期来我院指导临床工作，进行学术交流。2003年起承担医科大学医疗系本科生肿瘤学课程的教学任务。
开展的业务：头颈部肿瘤，如鼻咽癌、口咽癌、下咽癌、喉癌、副鼻窦癌等；胸部肿瘤，如肺癌、食道癌、乳腺癌、纵隔肿瘤；腹部肿瘤，如肝癌、胰腺癌、直肠癌、膀胱癌、前列腺癌、宫颈癌、宫体癌、睾丸肿瘤、阴茎癌、尿道癌等；中枢神经系统肿瘤，如垂体瘤、脑胶质瘤、转移瘤等；淋巴系统肿瘤，如淋巴瘤；皮肤肿瘤，如皮肤癌、恶性黑色素瘤等全身各部位恶性肿瘤的常规技术、三维适形技术放射治疗、三维适形调强放射治疗及肿瘤放疗化疗综合治疗。另外，开展了肿瘤所致上腔静脉压迫综合征、脊髓压迫等急诊放疗及骨转移癌止痛治疗。良性疾病的治疗，如瘢痕疙瘩、突眼及卵巢去势等。
专业特色是以肿瘤放射治疗为主的肿瘤治疗专科，放射治疗是肿瘤治疗的三大手段之一。2002年在疆内率先实现了全身各部位肿瘤的精确三维适形放射治疗，达到了国内先进水平。这一技术的临床应用是放疗技术的一次质的飞跃，实现了立体聚焦式放疗，达到了把射线的高能量聚集在肿瘤区，消灭肿瘤；减少或避免正常组织器官受照射，从而提高肿瘤局部控制率，降低放疗反应及并发症的目的。现已开展了三维适形调强放射治疗最新技术，同时，积极开展肿瘤放疗、化疗、生物综合治疗，并取得了良好效果。
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