内分泌科成立于1999年，现有病床50张，目前有主任医师一名，副主任医师3名，主治医师3名，住院医师4名，其中有研究生2名，在读研究生2名，人才梯度合理，集临床、教学、科研为一体，科室全体医护人员上下一心。
　　内分泌科技术力量雄厚，可开展所有内分泌系统疾病的诊治，包括临床常见病如1型糖尿病、2型糖尿病、甲状腺功能亢进症、甲状腺功能减退、痛风、骨质疏松等的规范诊疗，同时，对肾上腺疾病、垂体性疾病、继发性高血压等内分泌疾病的诊治也有丰富的临床经验。2008年我科率先建立双“C”工作站，成为皖南地区第一家胰岛素泵强化治疗中心，制定了糖尿病专科护士外出会诊制度、胰岛素泵管理制度，建立了安装胰岛素泵操作流程图，对糖尿病患者血糖控制良好的达标率为50％以上，远远高于全国平均水平。
　　科室在搞好临床疾病诊疗的同时，十分重视科研工作，不断开展新业务、新技术。在干细胞(脐血间充质干细胞)移植治疗1型糖尿病的临床研究中积累了丰富的经验，先后开展了近20例1型糖尿病患者的干细胞治疗，部分患者疗效显著，对2型糖尿病患者的干细胞治疗方案也在积极的筹备中。并首次开展系统性红斑狼疮患者的干细胞治疗。