针灸科创建于是1983年8月，为福建省卫生厅第一批中医重点专科(针灸学科唯一重点专科)、福建中医学院临床实习基地和福建省针灸培训基地、福建中医学院硕士点。
我科技术力量比较雄厚，共有卫生技术人员共25名，其中主任医师4人，副主任医师3名，主治医师2名，住院医师6名，主管护士护师5名，护(师)士8名，治疗师5名。科室设置合理，功能完善，设有住院病区、门诊针灸治疗中心、研究中心、康复医疗中心、牵引、理疗熏蒸中心和检测中心等八大分区，医疗设施比较先进，配备有日产MINATO电脑牵引床5台、三维牵引床1部、熏蒸床2台、中低高频理疗设备完善、全套多功能康复医疗设备、临床检测有肌电图、经颅多普勒、心电图和动态血压监测仪等。该学科带头人张永树主任医师是国家第三批老中医、中国针灸学会耳穴专业委员会理事、省针灸学会副会长、福建中医学院硕士研究生导师、教授、省医学学会委员，师承针灸名家留章杰，为我国近代针灸学家承淡安第三代传人。科主任苏稼夫主任医师系中国针灸学会文献专业委员会理事，福建中医学院硕士研究生导师、教授，省针灸学会副会长，泉州针灸学会会长。
该科中医特色浓厚，开设有应用传统的针灸和针药并用治疗中风后遗症、带状疱疹、腰椎间盘突出症、颈椎病、肝胆石症、泌尿系结石、哮喘、风湿性等临床专科专病。在群众中享有较大盛誉，在诊治疑难痛症方面，有独特的方法和较高疗效，常年均有来自省外及港、澳、台、东南亚各地的患者。
该科重视临床科研和学术交流，每年均有10余篇论文发表在全国各医学杂志上，承担厅级科研课题4个，另有1个入围部级科研项目。获市级科学技术进步奖2项。科室与泉州市针灸学会合编的《针灸界》已创办20余年，每年发行国内外4000余单位和个人，得到了针灸同仁的高度赞誉，《针灸界》已经成为我科对外联系的重要桥梁。
该科历年承担了大量的临床教学任务，每年除接受福建中医学院、泉州医高专等其他院校的实习生，多年来还有日本、菲律宾、印尼、美国、新加坡、港澳台等地的学者近40批100多人次前来求学访问。张永树、苏稼夫等多次受邀或公派前往东南亚、日本等地讲学诊疗。近年来连续承担3期福建省卫生厅下达“基层针灸医生技术培训”任务，已逐步成为集临床、科研、教学为一体的针灸基地。
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