全国治疗肛门瘙痒比较好的三甲医院有1、上海市第十人民医院，2、北京二龙路医院，3、首都医科大学附属北京朝阳医院西院，4、北京大学第三医院，5、海南省中医院等，肛门瘙痒属于肛肠科，上海市第十人民医院肛肠科疾病医疗设施齐全，在肛肠科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京二龙路医院肛肠科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名上海市第十人民医院肛肠科
上海市第十人民医院(暨同济大学附属第十人民医院),创建于1910年,1993年成为卫生部首批“三级甲等”综合性医院,拥有国家级重点学科2个,上海市重点学科4个,合作共建国家教育部“心律失常分子遗传重点实验室”,消化内科和护理部获得国家临床重点专科建设单位。
第二名北京二龙路医院肛肠科
北京市肛肠医院(北京市二龙路医院)创立于1937年，是一所以治疗肛肠疾病为特色，融医疗、教学、科研、预防为一体的医保定点二级甲等医院。2012年成立了“北京市肛肠疾病研究院”。医院设有肛肠外科、内科、外科、妇科、中医科、口腔科、眼科、五官科、骨科、针灸科、皮科等27个临床科室11个医技科室，下设德胜社区卫生服务中心及七个社区卫生服务站。2012年7月在西城区德外大街16号高科技园区内北院区投入使用，床位总量达到400张，医院建筑总面积3.9万平方米。
第三名首都医科大学附属北京朝阳医院西院肛肠科
首都医科大学附属北京朝阳医院创建于1958年2月24日，是北京市卫生 局直属医院，是集医疗、教学、科研、预防为一体的三级甲等医院，是首都医科大学第三临床医学院，医疗特色学科包括呼吸病学学科（国家重点学科）、心脏病学学科、泌尿病学学科、职业病与中毒医学学科、高压氧医学学科、器官移植学科、急诊医学学科、危重症医学学科、病理产科、检验医学学科，其中多个被确定为北京市重点学科、北京市医学重点学科或北京市医学重点扶植学科。
第四名北京大学第三医院肛肠科
北京大学第三医院建于1958年，国家卫生健康委委管医院，集医疗、教学、科研、预防、康复与保健为一体的综合性三甲医院。2018年底，在岗职工5157人，开放床位1891张。医院有36个临床科室、10个医技科室。有27个博士点、1个临床博士后流动站。在岗博士生导师57人，中国科学院院士1人、中国工程院院士2人，国家千人计划1人，国家自然科学基金杰出青年基金获得者3人、科技部“973”首席科学家1人、教育部“长江学者特聘教授”2人，2人入选国家级“新世纪百千万人才工程”，青年千人计划1人，国家自然科学基金优秀青年科学基金获得者4人，卫生部突出贡献专家10人。
第五名海南省中医院肛肠科
海南省中医院始建于1954年，是一所集医疗、科研、教学、预防、保健、康复于一体的综合性三级甲等中医医院，是广州中医药大学附属医院（非直属）。医院目前编制床位900张，实际开放床位665张。现有在册人员1037人，设有临床科室24个，医技科室10个,门诊部3个。医院人才荟萃，拥有一批包括国家特贴专家、全国名中医、全国老中医药专家、省优秀专家在内的中医药专家，有高级职称124人，中级职称191人，博士硕士96名。医院还“软”引进了包括国医大师石学敏院士在内的权威中医名家33名，极大地提升了医院的综合实力。 [收起]