全国治疗肠疾病比较好的三甲医院有1、上海市第七人民医院，2、深圳市中医院，3、南方医科大学中西医结合医院，4、上海曙光医院西院，5、广州军区总医院等，肠疾病属于肛肠科，上海市第七人民医院肛肠科疾病医疗设施齐全，在肛肠科疾病治疗方面有着丰富的经验；深圳市中医院肛肠科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名上海市第七人民医院肛肠科
上海市第七人民医院位于浦东新区外高桥区域，紧邻上海自由贸易试验区，是集医疗、科研、教学为一体、康复、健康管理为特色的三级甲等中西医结合医院，4次被评为卫生部先进集体，11次被评为上海市文明单位。医院重点学科建设卓有成效，拥有国家中医药管理局“十二五”重点专科肾病科；上海市医学重点专科康复科、上海市中医临床优势专科康复科、上海市中医临床重点学科中医肿瘤病学、上海市中西医结合重点病种湿疹、上海市传统医学示范中心；浦东新区重点学科临床药学、浦东新区重点学科群中西医结合康复医学学科群、浦东新区传统型中医临床示范学科中医肛肠科、浦东新区重点专科耳鼻咽喉科、浦东新区重点专科核医学科、浦东新区重点专科泌尿外科、浦东新区传统型中医临床示范学科中医男性科；并于2013年成立了健康管理部、脊柱外科。
第二名深圳市中医院肛肠科
深圳中医院于1975年成立,座落于深圳市福田区中心区,拥有建设单位2个(骨伤科、脾胃专科);市级重点医学专科4个。有国家二级实验室一所分子生物学实验室。在研课题100余项。先后中标国家自然科学基金科研课题6项、广东省自然科学基金科研课题4项,国家中医药管理局科研课题7项。
第三名南方医科大学中西医结合医院肛肠科
南方医科大学中西医结合医院是南方医科大学（原第一军医大学）附属医院之一，位于海珠区石榴岗路13号大院，现拥有国家重点学科中西医结合临床，还有国家中医药管理局重点学科6个(中医脑病学、中医肾病学、中医痹病学、中药药理学、中药制药学、中西医结合基础)、重点专科（病）建设单位4个（中西医结合风湿病、中西医结合慢性头痛病、针灸推拿科、中西医结合心血管病）和广东省中医药局重点专科（病）2个（中西医结合脾胃病、中西医结合肝病）。并拥有博士学位授权一级学科2个（中西医结合医学和中药学），硕士学位授权一级学科1个（中医学）。
第四名上海曙光医院西院肛肠科
上海中医药大学附属曙光医院是一所沪上的百年老院，三级甲等综合性中医院、位列上海十大综合性医院之一、全国示范中医院。1984—2008年十三次蝉联“上海市文明单位”称号;1999年荣获卫
第五名广州军区总医院肛肠科
广州军区总医院始建于1933年，是全国、全军首批三级甲等医院，医院设有60个专科，年门诊量125万人次。现拥有1个国家重点专病中心及2个博士后科研工作站；创建了创伤骨科中心、呼吸内科中心、临床麻醉中心、心血管病中心中心、激光整形中心、神经外科中心、下尿路疾病诊疗中心、辅助生育中心和临床护理培训中心9个全军医学专科(病)中心及全军临床药理基地、卫生信息技术基地；打造了12个军区医学研究所和专科中心、骨科被评为广东省重点专科，泌尿外科、心血管内科、中医科和药剂科被评为广东省特色专科。 [收起]