中医科是我院建立最早的科室之一。我市一代代的著名老中医曾在此供职，为我市中医事业和人民群众的健康做出了极大的贡献。随着时代的发展，我科坚定地走中医、中西医结合的道路。科室承担安徽中医学院、安徽医科大学、蚌埠医学院的临床教学工作，承接各科研机构的临床科研任务，是安徽省中医药学会肿瘤专业委员会的筹建单位。目前已经和中国中医科学院广安门医院、东直门医院、宣武医院、安徽中医学院、江西中医学院、省立医院中医科、蚌埠三院中西医结合科初步建立合作关系。
中医科基于中医专业的学科特点，同时出于方便病人就诊的目的，未作过于细致的分科。但在专业化方面，科室内部分为肿瘤组、内分泌组、心脑血管组、消化组、杂病组，分别负责相关专业的临床工作，在规范西医诊疗的同时，充分发挥中医药的优势和特色。作为我院唯一中医性质科室，在日常工作中，坚持临床和科研并重，促进中医、西医兼容并蓄，积极开展与相关西医科室的学术合作，更好地满足于人民群众的健康需求。同时，我科严格执行淮南市医疗保险方面关于中药(含有批准文号的中药制剂和中医治疗项目、中医药治疗费用)使用的相关优惠政策。
中医科现有副主任医师1名，主治医师4名，住院医师1名，是一只老中青结合、热爱中医、团结上进的集体。临床工作以内科疾病为主，中医儿科、妇科、男科颇具特色。专长于脾胃病、肝胆病、糖尿病、肾病、冠心病、肿瘤等内科疑难杂病的诊治以及妇科、男科病的治疗。
中医科学科优势：在肿瘤治疗方面，坚持“中西医结合为主，中西医并重”的原则。一方面，密切关注和学习肿瘤治疗的国际最新进展，另一方面，充分发挥中医药的优势和特色，通过中药内服、外用、静脉注射、灌肠、针灸等多途径、多手段综合治疗肿瘤。肿瘤患者对于手术、放疗、化疗的耐受程度均显著高于单纯西医治疗。
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