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1.重庆医科大学附属第一医院内科
重庆医科大学附属第一医院拥有国家卫健委“国家临床重点专科建设项目”17个（产科、检验科、重症医学、专科护理、内分泌科、心血管内科、胸外科、神经外科、麻醉科、神经内科、普通外科、眼科、呼吸内科、耳鼻咽喉科、肿瘤科、医学影像科、老年病科），数量居全国第12名。拥有国家中医药管理局“中医老年病重点专科”1个。获批卫生部培训基地14个，重庆市临床诊疗中心27个，重庆市医疗质量控制中心20个，重庆市专科护士培训基地10个。各学科均形成了自身的特色优势，综合诊断治疗水平居国内先进行列。
2.重庆医科大学附属儿童医院内科
重庆医科大学附属儿童医院于1956年由上海医学院儿科系迁渝创建，是集医教研为一体的国家三级甲等综合性儿童医院，国家临床医学研究中心。最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授予点、博士后流动站，是首批儿科学国家重点学科、教育部重点实验室、国家级国际科技合作示范基地、国家一流本科专业建设点、国家级继续医学教育基地、国家级教学团队、国家精品课程、国家食品药品监督管理局药物临床试验机构、全国儿科唯一的住院医师规范化培训示范基地、国家级儿童早期发展示范基地、儿科唯一获得肝移植资质的儿童医院、国家干细胞临床研究备案机构；拥有5个重庆市重点实验室和3个工程中心,全国文明单位。在全国最佳医院排行榜中连续多年位居全国儿童医院第三位，2018年度儿内科综合排名居全国儿童医院第三位，儿外科居第三位，科研产出居第一位。2018年中国医院科技量值(SETM)排名中，我院综合居全国儿童医院第二位。
3.重庆市人民医院内科
中国科学院大学重庆医院（重庆市人民医院）是重庆市首批三级甲等综合性医院。拥有重庆市重点学科心血管外科、骨科、老年病学科、耳鼻咽喉科学、医学检验科；重庆市临床重点专科重症医学科、医学检验科、麻醉科、骨科、消化内科、呼吸内科、老年病科、神经外科、神经内科、医学影像科、心血管内科。
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