全国治疗疟疾比较好的三甲医院有1、四川大学华西医院，2、上海交通大学医学院附属瑞金医院，3、复旦大学附属华山医院，4、首都儿科研究所附属儿童医院，5、上海市第六人民医院等，疟疾属于中医科，四川大学华西医院中医科疾病医疗设施齐全，在中医科疾病治疗方面有着丰富的经验；上海交通大学医学院附属瑞金医院中医科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名四川大学华西医院中医科

第二名上海交通大学医学院附属瑞金医院中医科
上海瑞金医院建于1907年,原名广慈医院,是一所三级甲等大型综合性教学医院。医院设有34个临床科室、9个医技科室;现有国家教育部重点学科3个(内分泌、血液、消化),上海市重中之重学科1个(血液),上海市重点学科1个(内分泌),上海市优势学科一个(肾脏),上海市教委重点学科6个(消化外科、血液科、内分泌科、骨科、烧伤科、心脏内科),上海市卫生局医学领先专业重点学科3个(消化外科、血液科、肾脏内科)。
第三名复旦大学附属华山医院中医科
复旦大学附属华山医院创建于1907年，是复旦大学附属综合性教学医院和中国红十字会直属医院，1992年首批通过国家三级甲等医院评审，全院共设39个临床医技科室，尤以神经内外科、皮肤科、手外科、中西医结合、传染病科、脊柱和关节外科、肾脏病科、泌尿外科、肾移植、胰腺外科、乳房外科、内分泌科、职业病和风湿科、颌面外科、影像医学和核医学、运动医学、康复医学为特长，其中神经外科、手外科、中西医结合科、泌尿外科、神经内科、传染病学和抗生素、肾病科、心血管科、影像医学和核医学、普外科为国家级重点学科，临床神经医学、手外科为上海市领先学科，神经外科、手外科被命名为上海市临床医学中心。
第四名首都儿科研究所附属儿童医院中医科
首都儿科研究所是一所以医学基础研究、儿科疾病发病机理研究、儿童保健为重点，承担有医疗、教学和预防任务的应用医学研究机构。其前身是中国医学科学院儿科研究所 ,成立于1958年，是新中国第一家儿科医学研究所。于1983年隶属北京市，1984年开设门诊，1986年建立附属儿童医院。1993年，在京郊顺义区组建“北京市医用生物制品中试基地”。研究所先后10次获得北京市属科研院所“改革与发展”一等奖，18次获得首都及卫生系统“文明单位”的称号。50多年来，经过几代人的不懈奋斗，研究所已发展成为集儿科基础医学、临床医学、高等医学教育、预防保健医学为一体的全国知名的医学研究机构。
第五名上海市第六人民医院中医科
上海第六人民医院建于1904年,是一所三级甲等大型综合性教学医院。核定床位1766张,实际开放床位1950张,设有33个临床科室、9个医技科室。20世纪五十年代末周永昌教授等开创了超声医学事业,被誉为“中国超声诊断发源地”。1963年陈中伟教授、钱允庆教授等在我院成功施行了国际医学史上第一例断肢再植手术,从此医院被誉为我国断肢再植的摇篮。 [收起]