脑外科为市首批重点学科，曾多次被市卫生局评为优秀学科，多年以来获得医院科技进步奖十余项。科室现有专科医生6名，其中主任医师2名，副主任医师(医学博士)1名，主治医师(在读研究生)2名，住院医师1名，并分别在上海华山、瑞金、仁济医院等大型医院脑外科进修深造。学科带头人石清泉主任医师曾在上海瑞金医院脑外科工作20多年，有着丰富的神经外科临床经验。
脑外科的诊疗、护理技术水平不断提升，在疑难杂症的诊治方面达到省级医院的水平。此外，科室与上海、杭州等地的大型医院有着固定的协作关系，在上级医院的指导下成功开展了多项高难度手术，并与杭州大医院开展远程会诊，真正方便和服务了患者，目前海岛神经外科疾病患者可以做到看病、手术不出岛。
脑外科凭借着医院先进的仪器设备、手术器械，目前开展的手术有：硬膜外血肿、硬膜下血肿、脑内血肿清除术，颅骨缺损修补术，脑溢血微创血肿清除术，脑脓肿摘除引流术，大脑胶质瘤、小脑半球胶质瘤摘除术、第四脑室肿瘤切除术，脑膜瘤摘除术(大脑凸面、颅底、天幕、桥小脑角等脑膜瘤)，听神经肿瘤摘除，脑垂体瘤摘除(经额、经蝶入路)，脑干肿瘤摘除术，各类颅骨肿瘤切除术，寰枕部畸形(扁平颅底、颅底陷入、小脑扁桃体下疝畸形)手术，颅内动脉瘤夹闭切除术、颅内动静脉畸形切除术，颅内血管性病变介入治疗，脑积水脑室脑池分流、脑室腹腔分流，椎管内肿瘤摘除(颈椎、胸椎、腰椎、神经鞘瘤)，脊髓肿瘤切除术(髓内肿瘤)，珠网膜囊肿摘除术，脑室镜下血肿清除术，脑及脊髓微创手术，神经血管内介入治疗。
脑外科近几年手术量逐年上升，年手术量一般在250例以上，其中Ⅳ类及特类的手术占60%左右，抢救了一大批重症颅脑损伤及脑溢血等疾病的病人，受到社会各界人士的赞扬。
脑外科至今开展新技术、新项目60余项，其中获得院科技进步奖10余项，2000年、2002年分别获市卫生局重点学科带头人三等奖和二等奖。在国家和省级专业杂志上发表论文数十篇。近几年相继开展了脑及脊髓的微创手术如脑溢血、脑及脊髓肿瘤的显微外科治疗，还开展了神经血管内介入治疗如脑恶性肿瘤介入化疗、颅内动脉瘤、颅内动静脉畸形、颈内动脉海绵窦瘘的介入治疗，达到省内先进水平。
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