呼吸内科是厦门市规划重点学科,现有医护人员60余人,其中医生20人,高级职称5人（主任医师3人,副主任医师2人）,博士2人,硕士11人。有教授、硕士研究生导师、享受国务院政府特殊津贴专家。科室设有两个病区,编制床位90张。每天开放呼吸专科门诊三间,呼吸专家门诊两间。另开设“成人哮喘专家门诊”,“肺部肿瘤门诊”,鼾症门诊和戒烟门诊。年出院病人近3000人次；年门诊量6万余人次。
呼吸内科病区设有10张病床的呼吸重症监护病房,内设中央监护、层流和重症VIP病房,拥有瑞士产新型（金型）伽利略,美国泰科新型PB840、德国产新型德尔格Evita-4和西门子新型Servo-i等一批高档有创呼吸机,美国伟康无创呼吸机及美国惠普监护仪；按国际标准建有隔音墙壁,红外线摄像和对讲系统的国内一流的睡眠呼吸监测中心,配备全球一流,澳大利亚Compumedics无线遥距睡眠监测系统；病区设有优质病房8间和多媒体中控投影示教室。
呼吸内科附设800平方米世界一流的现代一体化的呼吸内镜和肺功能综合诊疗部,内设支气管镜术前麻醉准备间,呼吸内镜检查室3间和呼吸内镜洗消中心,配备日本产支气管镜诊治系统3套；德国产爱尔博（ERBE CA）型多功能冷冻治疗仪。设有肺功能检查室2间（运动心肺检查室1间）,肺功能雾化治疗室1间,配备价值170万元的全球最先进、国内独家、最新型、高级组合模块式、数字化并可无限升级的全配套（包括体描、运动等）的德国原装进口的JAEGER（耶格）专业肺功能检测系统；设有呼吸内镜和肺功能示教室（装备辐射支气管镜和肺功能各个检查室的红外线摄像系统和多媒体投影）,内设呼吸实验室3间,配备先进的科研试验仪器（日本尼康Eclipse 80i生物显微镜；德国LEICA EG 1150H,LEICA EG 1150C自动石蜡包埋系统；德国Leica RM2245半自动转轮切片机；美国GeneAmp PCR System 9700基因扩增仪；德国Hettich离心机MIKRO 220R；美国Thermo Fisher超低温冰箱revco Value系列ULT1386-3-V42）；内设资料室1间及其他附属设施。
呼吸内科开展的项目开展肺癌的分子靶向治疗,睡眠呼吸暂停低通气综合征（鼾症）的诊断和治疗,肺血栓栓塞症的溶栓和介入治疗,支气管镜的各种检查和经内镜介入治疗新技术,经皮肺活检,胸膜活检术,胸膜固定术,支气管动脉栓塞治疗大咯血,开展全部肺功能项目检测。应用德国百瑞压缩雾化泵治疗门诊支气管哮喘和急性呼吸道感染。对急、慢性呼吸衰竭病人行支气管镜经鼻引导气管插管进行机械通气治疗。
呼吸内科对支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病（COPD）、肺血栓栓塞症和呼吸道感染等疾病,分别按照哮喘防治全球创议（GINA）、慢性阻塞性肺疾病防治全球创议（GOLD）、全国肺血栓栓塞规范化诊疗方案及中国呼吸道感染优化治疗方案等相关指南进行规范化诊治。
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