全国治疗自闭症比较好的三甲医院有1、新乡医学院第二附属医院，2、锦州市中心医院，3、齐医第二附属医院，4、牡丹江市妇女儿童医院，5、随州市中心医院等，自闭症属于儿科，新乡医学院第二附属医院儿科疾病医疗设施齐全，在儿科疾病治疗方面有着丰富的经验；锦州市中心医院儿科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名新乡医学院第二附属医院儿科
新乡医学院第二附属医院是一所享誉全国的大型公立精神卫生专科医院，是集医疗、教学、科研、预防、康复、保健、司法精神医学鉴定为一体的省级精神、神经疾病专科三级甲等医院。医院始建于1951年6月，前身是中国人民解放军平原军区后方医院三分院。1957年5月，被河南省卫生厅定名为河南省精神病医院。为配合新乡医学院教学工作，1994年3月新增名称新乡医学院第二附属医院。2010年为顺应精神卫生事业的发展，医院新增名河南省精神卫生中心。目前，医院同时使用“河南省精神病医院、河南省精神卫生中心、新乡医学院第二附属医院”为名称。
第二名锦州市中心医院儿科
锦州市中心医院坐落于锦州市区中心，始建于1948年，现已发展成为一所集医疗、教学、科研、预防、保健、急救、康复为一体的大型综合性国家三级甲等医院，锦州地区唯一一家全国百姓放心示范医院，全国首批住院医师规范化培训基地、慢病防控示范基地、脑卒中筛查与防治基地，辽宁省全科医师临床培养基地，辽宁医学院锦州临床学院、辽宁中医药大学和赤峰学院教学医院。先后荣获全国卫生系统先进单位、全国医学人文管理荣誉奖、辽宁省文明医院、辽宁省卫生系统诚信服务杯标兵单位等近百项荣誉称号。
第三名齐医第二附属医院儿科
齐齐哈尔医学院第二附属医院始建于1972年，前身为嫩江地区中心医院，位于风景秀丽的嫩江东岸，与齐齐哈尔大学毗邻。经过几代人的砥砺奋进，现已发展成为一所集医疗、教学、科研、急救、预防、保健为一体的大型三级甲等综合性医院、医保定点单位。　医院建筑面积5.8万多平方米，现有职工1200余人，开放床位900张，设有临床及医技科室47个，临床教研室15个，齐齐哈尔医学院血液病研究所和精神卫生研究所设在我院。...
第四名牡丹江市妇女儿童医院儿科
牡丹江市妇女儿童医院是一所集医疗、保健、科研、教学于一体的妇女儿童专科医院,承担全市妇女儿童的临床诊疗、保健预防、健康教育、科研等任务。2010年医院通过等级评审,以全省总分第一名的好成绩晋升为黑龙江省东部地区唯一一家三级甲等专科医院。医院总建筑面积17582平方米,设置床位175张。医院拥有硕士研究生34名,市级学科带头人3名及一大批享有盛名中青年专家,先后有20余人在市医院学会担任主任委员、副主任委员、秘书等职务。目前,医院以保健市场为依托,以临床技术为支撑,不断探索临床保健相结合模式,使两者相互融合、相互支持,经济效益突破性增长,品牌学科不断涌现。
第五名随州市中心医院儿科
医院开放病床800张，设有28个临床科室，39个专业组，9个医技科室，20个一级诊疗科目,31个二级诊疗科目,1个实验室，承担多所医学院校的临床实习带教任务，是华中科技大学同济医学院、武汉大学医学院、湖北中医学院、郧阳医学院的教学医院，是同济医学院的科研基地。 [收起]